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1.
运用网络药理学及分子对接联合GEO芯片分析的方法，分析红花治疗冠心病的分子靶点和作用机制。通过TCMSP平台筛选红花的有效成分和靶点；在GEO芯片数据库检索、分析、筛选芯片数据并提取冠心病的差异表达基因；将获得的药物靶点与疾病靶点取交集基因，使用STRING平台对关键靶点构建蛋白互作网络；利用Metascape数据库对关键靶点进行GO和KEGG富集分析，应用AutoDockTools软件进行分子对接，预测作用机制。共获得红花17个有效成分，对应218个作用靶点，药物靶点与疾病靶点交集基因22个；筛选到核心活性成分黄芩素、β-胡萝卜素、β-谷甾醇等，核心靶点VEGFA、MMP9、JUN等；GO和KEGG分析呈现生物过程199个，细胞组分17个，分子功能19个，富集通路涉及到IL-17信号通路、糖尿病并发症相关AGE-RAGE信号通路等；分子对接结果β-胡萝卜素、豆甾醇等与核心基因结合良好。文章初步揭示红花治疗冠心病的活性成分、作用靶点及信号通路，红花通过多成分、多靶点、多通路的方式发挥治疗冠心病的效用。 相似文献
2.
目的：基于网络药理学及分子对接技术，探究四神煎治疗糖尿病周围神经病变（Diabetic peripheral neuropathy,DNP）的药理分子机制，为经典方剂临床应用提供初步的现代理论依据。方法：通过Batman-TCM数据库（http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/）获取黄芪、石斛、牛膝、远志、金银花五味中药的主要化学成分及靶点信息；利用String11.0数据库（https://www.string-db.org/）进行蛋白质相互作用分析，构建PPI网络并进行可视化分析，预测其中发挥作用的主要蛋白靶点。在Metascape数据库进一步分析核心靶点参与的生物过程及通路，采用CytoScape 3.8.0软件构建“四神煎成分-核心靶点-通路”关系网，分析其中主要发挥作用的成分及关键靶标，最后运用AutoDockTools-1.5.6进行分子对接，对接结果用PyMOL显示。结果：得到四神煎治疗DNP的活性成分79个，对应靶点456个，交集核心靶点113个，预测四神煎治疗DNP的主要活性成分为茉莉酮，核心基因ALB、TNF、PTGS2、CREB1、CA... 相似文献
3.
《科技风》2021,(21)
目的:基于网络药理学探讨龟鹿二仙胶(Gui-Lu-Er-Xian-Jiao, GLEXJ)治疗肿瘤放化疗后骨髓抑制(bone marrow suppression, BMS)的作用机制。方法:运用TCMSP、TCMID数据库获取活性成分和作用靶点,在GeneCard、DisGeNET等数据库检索疾病靶点,成分靶点与疾病靶点映射后利用Cytoscape软件构建GLEXJ"活性成分-靶点-疾病"调控网络,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建PPI网络,metescape数据库进行GO和KEGG富集分析,利用AutoDock软件进行分子对接验证。结果:筛选得GLEXJ 86个活性成分,度值较高的化合物有槲皮素、山萘酚、豆甾醇、β-谷甾醇等,其作用于ESR1、RELA、EGFR、FOS等89个关键靶点,这些靶点主要富集在MAPK、TNF、PI3K-Akt等与BMS相关的通路上。分子对接结果显示:槲皮素、豆甾醇等成分与RELA、CCND1等核心靶点具有较强的结合活性。结论:GLEXJ治疗BMS的作用体现了中药多成分、多靶点、多通路的特点,其机制可能与调控细胞增殖、调节细胞周期、调控氧化应激等多方面相关。 相似文献
4.
文章运用反向分子对接的手段探讨四方藤抗类风湿性关节炎的机制。选择四方藤中11个主要化学成分,应用Chem Bio Draw软件画出化学结构式,通过Pharm Mapper数据库分析预测潜在作用靶点,运用DAVID和KEGG数据库预测其作用通路信息,并构建四方藤作用机制网络。得到EGFR,MAPK1 PDPK1等四方藤主要成分作用靶点122个,并聚焦到21条相关通路,这些通路主要与炎症反应、糖尿病、癌症相关。结果表明,瑶药四方藤抗类风湿性关节炎作用可能与炎症反应中的相关靶点和通路有关。 相似文献
5.
目的：通过网络药理学研究护肝宁片治疗乙型肝炎的作用机制。方法：利用TCMSP数据库收集护肝宁片活性成分，构建化合物—靶点图。通过GeneCards和OMIM数据库获取乙型肝炎相关靶点，将护肝宁片活性成分靶点与乙型肝炎疾病靶点取交集，得到关键靶点。通过对共有核心靶点进行蛋白质相互作用分析，分析蛋白相互作用（PPI）中度中心度（DC）、中间性中心性（BC）、紧密性中心性（CC）筛选核心靶基因。选取的护肝宁片主要活性成分与关键靶点进行分子对接。结果：筛选到护肝宁片中木樨草素、槲皮苷、隐丹参酮、丹参酮等81种主要化学成分和198个相关靶点，其中关键靶点有TP53、AKT1、VEGFA、STAT3等。护肝宁片中的活性成分可能通过线粒体、膜筏等细胞组分参与DNA生物合成、细胞凋亡、星形胶质细胞的激活等多种生物学过程，作用通路为乙型肝炎、PI3K-AKT等。分子对接结果显示主要化学成分与核心靶点的结合力均较强，蛋白结晶复合物构象稳定。结论：研究初步表明了护肝宁片通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗乙型肝炎的作用机制。 相似文献
6.
目的:基于网络药理学探究益肾活血方治疗糖尿病肾病(Diabetic nephropathy,DN)的活性成分和作用机制.方法:通过TCMSP数据库分析益肾活血方的活性成分及靶点;借助GeneCards、OMIM及TTD数据库收集DN的靶点;利用韦恩工具取二者的交集靶点,借助STRING平台构建交集靶点的蛋白互作网络;采用Cytoscape 3.7.2软件构建"成分-疾病-靶点"网络图;通过DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路分析.结果:筛选出益肾活血方活性化合物123个,核心化合物为槲皮素、山柰酚、木犀草素、黄芩素、异鼠李素、丹参酮ⅡA.核心靶点为IL-6、VEGFA、CASP3、BCL2、PTGS1等.KEGG通路主要涉及AGEs/RAGE信号通路、PI3K/Akt信号通路等.结论:黄酮类化合物及丹参酮ⅡA为益肾活血方治疗DN的核心成分.益肾活血方可能作用于IL6、VEGFA、PTGS1等核心靶点基因调控AGEs-RAGE通路,作用于CASP3、BCL2、VEGFA等核心基因调控PI3K/Akt信号通路,延缓糖尿病肾病的发展. 相似文献
7.
目的:利用文献计量学方法归纳各方使用中药内服治疗急性腰扭伤的用药规律,然后运用网络药理学方法对得出的高频药对进行分析.方法:计算机检索中外数据库,收集有关使用中药内服治疗急性腰扭伤的临床研究.结果:严格按照纳入标准对所检索文献进行筛选,"赤芍-续断"为最高频次药对.通过网络药理学方法分析"赤芍-续断"药对,发现其有效化学成分有35个,对应101个作用靶点,靶点富集出9条信号通路.其中赤芍化合物-苯甲酰芍药苷的关键作用靶点-血浆组织因子显著富集于HIF-1信号通路.结论:赤芍可以通过调控血浆组织因子使其作用于HIF-1信号通路以减少机体因创伤而致的瘀血凝聚症状,推测"赤芍-续断"药对治疗急性腰扭伤具备疗效. 相似文献
8.
信号通路在支气管哮喘发病机制及针灸治疗支气管哮喘作用机制的研究中都具有举足轻重的作用.针灸通过多靶点调控信号通路从而影响支气管哮喘的预后与转归.文章从TGF-β1/Smads、PI3K/AKT、JAK/STAT、NF-κB、ERK等信号通路入手,对基于信号通路探究针灸治疗哮喘的作用机制进行综述,可为深入探究针灸治疗哮喘的信号通路机制指明方向. 相似文献
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《科技风》2020,(23)
目的:利用网络药理学研究疏风解毒胶囊防治病毒的活性化合物。方法:通过TCMSP检索疏风解毒胶囊中8味中药败酱草、板蓝根、柴胡、甘草、虎杖、连翘、芦根、马鞭草的化学成分与作用靶点。借助Uni Prot数据库查找靶点对应基因,应用Cytoscape3.7.2软件构造出药材-化合物-靶点网络,进而使用cluster Profiler R包对靶点进行GO功能分析和KEGG通路分析。结果:研究筛选得到151个化合物和相应靶点144个。GO功能分析得出1385个GO条目(P0.01),包括1194个BP条目,66个CC条目,125个MF条目,分别占86%、5%、9%。KEGG通路分析获得111条信号通路。结论:疏风解毒胶囊中的活性化合物对病毒有防治效果。 相似文献
10.
日官孜玛是治疗胃溃疡的常用道地藏药材，但其物质基础和作用机制尚不清楚。本研究通过网络药理学和H2O2诱导的体外胃粘膜损伤模型，研究日官孜玛总提取物及其4个单体化合物Al ocryptopine(A)、Bicucul ine(B)、Cheilanthifoline(C)、Protopine(D)对过氧化氢(H2O2)诱导的人胃粘膜上皮细胞(GES-1)炎症的保护作用，以揭示其抗炎作用的物质基础和主要作用机制。通过网络药理学方法共收集日官孜玛活性成分17个、潜在靶点525个、与胃溃疡相关疾病靶点4 232个，活性成分靶点与疾病靶点交集后获得263个核心靶点。GO富集分析结果显示这些基因主要影响细胞信号转导、核受体的活性、蛋白质结合等生物过程。KEGG富集分析显示PI3K-AKT信号通路和一些癌症相关通路的基因富集较多。体外实验结果显示AKT1、HASP90AA1、MAPK1、PIK3CA是其重要靶点。MTT结果显示，与正常组相比，200μg/m L日官孜玛总提物表现出显著的细胞毒性；单体化合物B在25～... 相似文献
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《黑龙江科技信息》2019,(32)
目的:研究影响肺腺癌生存率的因素,突变基因的信号通路分析,为研究肺腺癌的发病机制和临床诊治提供指导。方法:从cBioPortal数据库下载522例肺腺癌患者数据。采用R软件分析数据的基本信息,研究生存分析,关键信号通路与肺腺癌的关系。结果女性患者占比53.64%,患者的平均年龄为65.33岁,且大部分为60岁及以上的老年人,老年患者占比72.42%,吸烟患者占比为85.24%。有其他恶性肿瘤病史的患者中位生存时间为21.4个月,无其他恶性肿瘤病史患者的中位生存时间30.8个月,且具有统计学意义(p=0.0057)。信号通路富集分析中钙粘蛋白信号通路,Wnt信号通路,烟碱乙酰胆碱受体信号通路等通路具有显著的统计学意义。结论:肺腺癌是否有其他恶性肿瘤病史与生存时间有关,携带有其他恶性肿瘤病史的患者生存时间减少。肺腺癌与Wnt信号通路,钙粘蛋白信号通路,烟碱乙酰胆碱受体信号通路等信号通路有关。 相似文献
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抑郁症作为一种常见的精神障碍性疾病已经严重危害人类的健康,其发生发展过程伴随着严重的免疫紊乱现象。而天然冬虫夏草多糖具有良好的免疫调节药理活性,因此,本研究采用网络药理学联合分子对接技术,对天然冬虫夏草多糖抗抑郁作用的潜在机制进行了研究。研究结果表明,天然冬虫夏草多糖可能通过调节PI3K-AKT、HIF-1和JAK-STAT等通路及EGFR、STAT3、PRKACA、TP53和IL-1β等靶点,发挥了其免疫调节功能,从而实现抗抑郁作用。 相似文献
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人和果蝇基因组中的原癌基因ras被激活后可抑制细胞凋亡，该信号传导的具体通路是研究ras致癌作用的热点，其具体机制的阐明有助于了解ras的其他功能，并可为抗癌药物的设计提供新的靶点。本文简述该传导通路的研究进展。 相似文献
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信号转导通路在癫痫中的作用是近年来癫痫基础研究的热点。其中细胞外信号调节激酶(ERK1/2)信号转导通路是一条重要的信息传递通路,可通过磷酸化后参与神经元的兴奋过程,进而影响癫痫的发病机制,研究认为,ERK1/2磷酸化是癫痫发作过程中细胞的早期反应之一,可作为阻止癫痫发作的潜在治疗靶点。文章主要从对ERK信号通路的认识以及ERK信号通路如何参与癫痫的发病机制、ERK信号通路相关的癫痫治疗来阐述当前的研究进展,为寻求治疗癫痫新药物提供理论依据。 相似文献
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目的:基于体外实验和分子对接研究枫杨抑菌活性及机制。方法:以枫杨果、树皮、叶为研究对象,分别研究其水提物和醇提物(70%乙醇)对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、绿脓杆菌、伤寒沙门菌、化脓性链球菌、表皮葡萄球菌的抑菌活性,确定抑菌谱和最小抑菌浓度(MIC)。利用活性追踪方法,通过硅胶吸附色谱、薄层色谱等手段,分离单体化合物,并进行抑菌活性研究,选择PBP5、FabI、FabH、Fts Z 4个抑菌关键蛋白靶点,利用Systems Dock Web Site软件进行分子对接,研究其抑菌机制。结果:实验发现枫杨果的醇提物抑菌效果最好,对伤寒沙门菌最小抑菌浓度为7.81 mg/mL,首次从枫杨果中分离得到β-谷甾醇、β-胡萝卜苷、齐敦果酸,三个化合物对于PBP5、FabH、FtsZ蛋白靶点Docking score均大于7,结果活性很好。结论:枫杨果醇提物抑菌谱广、抑菌能力强,其可能是通过抑制革兰氏阳性菌细胞壁肽聚糖的合成,以及细菌脂肪酸的生物合成,干扰其生物膜的形成从而抑制细菌的生长和繁殖,从而起到广谱的抗菌效果。 相似文献
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《科学中国人》2021,(16)
正驯化下早期物种形成的基因组调控机制中国科学院昆明动物研究所张亚平院士团队与合作者利用欧洲大白猪与东亚民猪杂交群体,构建了F2通过F1继承F0基因组序列的精细图谱,通过分析F2代个体中的大白与民猪来源的基因互作,研究了在驯化下早期物种形成的基因组调控机制。相关成果发表于MolecularBiologyandEvolution。研究揭示了F2基因组内的DMI数量存在显著的性别差异,以及从F1到F2的同性别/跨性别传递差异。大白猪和民猪基因组间不兼容互作基因主要富集于血管生成、雄激素受体信号和T细胞受体信号通路,提示生殖隔离进化可能与生长发育与免疫等方面的选择作用相关。 相似文献
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目的：为某建筑施工企业结合OHSMS（职业健康安全管理体系）建立健全双重预防机制。方法：从基层的员工到最高的管理者应用LEC评价法，进行风险辨识、分析、评价和管控，构建危险源、风险和措施数据库，通过信息化技术导入数字化安全与风险管理系统，并加以完善。结果：危险源数据库共计819个，其中一级风险（红）78个（D≥160），二级风险（橙）179个（160>D≥70），三级风险（黄）238个（70>D≥20），四级风险（蓝）324个（20>D）。数字化安全与风险管理系统由Web端和微信端组成，Web端由3个子系统、13个功能模块和18个功能子模块组成，微信端由2个子系统、5个功能模块和6个子功能模块组成。结论：某建筑施工企业双重预防机制在OHSMS中实现信息化、数字化、可视化管理，简化工作流程，降低人员的劳动强度，更好地发挥双重预防机制降低风险，起到遏制事故发生的作用。值得注意的是，双重预防机制应与OHSMS有机融合，持续改进；LEC评价法获取的危险源、风险和措施数据库需要进行动态管控、数据优化并持续更新和完善；为其他建筑施工企业和其他领域建立健全双重预防机制提供借鉴。 相似文献