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后基因组时代,如何从大量的蛋白质相互作用(PPI)数据中寻找特定信息并以图形方式显示是迫切需要解决的问题.为此,本文提出了一种基于极大团扩展的蛋白质复合物聚类算法,该算法通过一种基于极大团扩展的蛋白质符合物识别算法构造功能模块,对PPI网络中的功能模块进行聚类,通过将功能模块用抽象节点代替的方法将PPI网络层次化,这样不但降低了复杂性而且提高了PPI网络中信息的可阅读性.同时采用增加、删除、修改数据的方法对算法进行稳定性分析.结果表明,该算法具有较好稳定性.对于其他具有相似结构的网络,该方法也具有借鉴意义. 相似文献
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目前针对图书管理信息数据的研究方法与手段众多,文章利用最新的复杂网络研究手段及方法对选取的图书借阅典型数据进行了全面的可视化实证分析研究,具体包括借阅数据结构可视化、社团规划可视化和数据链路预测可视化,深入讨论了各种可视化实现的具体工具及代表算法,尝试阐明复杂网络与图书管理数据相结合的研究机制,试图为搭建高效合理的图书借阅环境提供一种比较实用的新方法. 相似文献
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目的：基于网络药理学及分子对接技术，探究四神煎治疗糖尿病周围神经病变（Diabetic peripheral neuropathy,DNP）的药理分子机制，为经典方剂临床应用提供初步的现代理论依据。方法：通过Batman-TCM数据库（http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/）获取黄芪、石斛、牛膝、远志、金银花五味中药的主要化学成分及靶点信息；利用String11.0数据库（https://www.string-db.org/）进行蛋白质相互作用分析，构建PPI网络并进行可视化分析，预测其中发挥作用的主要蛋白靶点。在Metascape数据库进一步分析核心靶点参与的生物过程及通路，采用CytoScape 3.8.0软件构建“四神煎成分-核心靶点-通路”关系网，分析其中主要发挥作用的成分及关键靶标，最后运用AutoDockTools-1.5.6进行分子对接，对接结果用PyMOL显示。结果：得到四神煎治疗DNP的活性成分79个，对应靶点456个，交集核心靶点113个，预测四神煎治疗DNP的主要活性成分为茉莉酮，核心基因ALB、TNF、PTGS2、CREB1、CA... 相似文献
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复杂网络可视化的基础是关系图的可视化及其相关作图算法,在处理大规模网络时都会面临性能和可阅读性的问题。文章定义了"边强度",提出了基于"边强度"的分裂算法,量化了社团结构,定义了"社团网络"的两个重要属性,并提出了网络分割算法;提出了一种"多级抽象"的思想来降低大规模网络的可视化规模;使用作图算法中的十分经典的模型——力引导模型来将抽象层次不同的网络进行可视化处理,使之可以实现视图的交互呈现。 相似文献
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有一些研究已经表明生物系统是由功能模块间的相互作用组成的。因此,鉴别这些功能模块对于理解生物系统的模块性和组织结构是十分必要的。本文提出了一个框架来鉴别功能模块通过整合蛋白质互作网络和基因表达谱数据。应用算法于双重加权酵母蛋白质互作网络中,得到了120个功能模块。这些模块显著的富集在蛋白质相关的GO的生物学过程上。因此,本文提出的算法可以很好的挖掘蛋白质互作网络中功能模块。 相似文献
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由于网络舆情信息具有明显的大数据特征,使用传统的数据收集、分析与表现方法不仅存在效率低下的问题,而且难以发现其中的关键信息以及信息背后的潜在特征。就此而言,发端于科学计算领域的可视化分析技术能够化繁为简,用易于理解的图形图像揭示网络舆情的分布、发展和演化规律,因而在网络舆情研究中具有非常显著的应用价值。本文根据网络舆情信息呈现形式上的差异,分别探讨了层次信息、文本信息和关系网络信息可视化方法在网络舆情研究中的应用范式和实现途径,以期推进网络舆情研究的纵深化。 相似文献
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数据挖掘及其在网络信息检索中的应用 总被引：1，自引：0，他引：1
网络信息检索经过近几年的发展,在一定程度上满足了人们查找知识的需要,但是在检全率和检准率上还是不尽如人意.将数据挖掘技术运用到信息检索中,可使未来的网络信息检索更加精准、个性和智能化.介绍了数据挖掘的概念和方法,并分别从内容挖掘、结构挖掘、使用挖掘三个方面对网络数据挖掘进行了阐述,并主要从搜索引擎的角度探讨了数据挖掘在网络信息检索中的应用,分析了数据挖掘与信息过滤和可视化技术的结合,最后对网络信息检索未来发展进行了展望. 相似文献
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社会网络研究的深入使社会网络可视关系的研究成了当前学术研究的热点,目前广泛使用的可视化分析工具如Ucinet,Pajek等使用图论来展示个体间的网络关系,而忽略了节点自身所具有的属性特征。因而如何同时展示网络关系与节点属性成为当前社会网络可视分析亟待解决的问题。本文针对这一问题,以2003-2012 JASIST（美国信息科学技术学会会刊）合作网络的可视化分析为例,探讨了如何揭示关系网络中节点本身所具有的属性信息,为多属性社会网络的可视化分析提供了一个新的视角。 相似文献
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运用可视化的方法对低碳城市研究的高频关键词的共现矩阵进行分析,构建了共现聚类树和共现网络。研究表明:低碳城市研究中,宏观研究占据主导地位,中观研究逐渐成为热点,微观研究需要快速起步。并在此基础上对低碳城市系统的若干热点和未来研究趋势进行了预测。 相似文献
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本文以西门子PPI网络为基础,构建了模拟自动生产线各个不同生产单元中PLC相互通讯的网络控制方案,同时采用模块化的设计思想,通过MicroWIN编程软件,按照功能对整个控制系统进行了程序的编制和调试,达到了较好的控制效果。 相似文献
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采用Yong的网络成瘾量表和郑日昌编制的人际关系综合诊断量表对安庆师范学院的200名学生进行问卷调查,结果表明:男大学生在网络成瘾上显著高于女大学生;大学生网络成瘾在年级上差异显著,大三、大四在网络成瘾度上显著高于大一;并且随着年级增高,网络成瘾有上升趋势;交谈行为、待人接物对大学生网络成瘾具有很好的预测作用.结论:大学生人际关系对网络成瘾具有良好的预测作用. 相似文献
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Pajek在情报学合著网络可视化研究中的应用 总被引：11，自引：1，他引：10
介绍了大型网络分析和可视化软件Pajek,重点介绍了它的可视化功能.并以<情报理论与实践>合著网络为例,系统地阐述了网络的建立、网络图的绘制以及导出过程.在此基础上对其中有代表性的子网络进行了具体的分析,说明了期刊的合著情况,并通过这一具有代表性的期刊反映出了情报学学科整体的科研合作情况. 相似文献
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信息可视化可以让我们直观地观察某个主题在一定时间段的研究现状。本文在对2000-2009年情报服务研究论文640个关键词统计分析的基础上,选取33个高频词作为研究主题的可视化对象。利用可视化工具Ucinet和PASW绘制了关键词网络的多维尺度分布图,并从定量的角度判断了情报服务10年来的研究热点和未来的研究趋势。最后本文提出了情报服务研究的4点思考。 相似文献
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能有效预测在线社交网络中人的行为有较高的应用价值,对当前在线社交网络存在多种交互方式的现象进行分析,以此构建一种多维社交关系的在线社交网络链路预测的方法。基于社会影响和选择两种机制构建在线社交网络多维网络结构,综合各个维度节点和连边的拓扑结构,实现多维社交网络预测矩阵的集结,在降维后的网络上进行链路预测。利用百度贴吧数据集实验验证,从AUC和精确度两方面评价模型,结果表明本文提出的多维预测方法是有效的。 相似文献
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随着在线社交网络规模的指数性增长, 可视化分析成为理解社交媒体
及用户的重要手段。 文章针对社交媒体、社交用户 、社交媒体与用户的交互 3 个
角度, 从社交媒体主题可视化建模、社交用户偏好可视化建模、社交网络个性化
检索可视化 3 个方面,分析社交网络可视化技术的研究成果。 提出时空融合可视
化、“三网 ”融合可视化等未来国内研究方向。 以期利用在线社交网络, 为互联网
服务、国家安全提供有力支撑。 相似文献