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相似文献
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1.
研究目的:评价毒死蜱施用后对土壤细菌和真菌群落结构的影响,并对降解功能菌株进行分析。创新要点:通过聚合酶链式反应–变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)方法,揭示了毒死蜱施用后土壤细菌和真菌群落结构动态变化,并对试验土壤中的降解菌群进行分子鉴定。研究方法:将农田土壤用终质量分数5 mg/kg和20 mg/kg毒死蜱处理,同时以不施用毒死蜱为对照,定期采集土样进行毒死蜱残留测定并提取土壤DNA。将提取的土壤总DNA作为PCR反应模板,细菌群落结构分析采用对大多数细菌16S rRNA基因V3区具有特异性的引物GC-341F和517R,真菌群落结构分析采用ITS区特异引物对GC-ITS1f和ITS2f。DGGE图谱经Quantity One软件进行数字化分析,各泳道中的条带经标准化处理之后,条带的相对光密度构成一个矩阵,用Matlab软件进行主成分分析(PCA),用Dice法计算相似性指数CS,用MEGA 4.1软件构建系统发育树,进行聚类分析。之后,采用LB、察氏和高氏三种培养基结合的纯培养分离方法,从毒死蜱处理土样中分离具有降解功能的菌株。分别提取纯培养物的染色体DNA,利用ERIC-PCR对分离到的降解菌进行基因组指纹图谱分析,将典型肠杆菌基因间的重复共有序列–聚合酶链式反应(ERIC-PCR)指纹图谱类型的代表菌株进行16S rRNA基因(细菌和放线菌)或ITS区(真菌)扩增并测序,测序结果提交GenBank基因库,并进行BLAST比对,初步确定降解菌株的分子地位。重要结论:本实验条件下,毒死蜱降解符合一级动力学,5 mg/kg和20 mg/kg毒死蜱浓度下的降解方程分别为y=5.252e-0.09x和y=19.41e-0.08x。DGGE指纹图谱显示,毒死蜱施用后土壤真菌群落结构与对照相比发生很大改变,且毒死蜱处理样品真菌群落结构保持基本稳定,多样性指数明显提高(见图2b);主成分分析显示,毒死蜱处理样品与对照明显分在2个不同的区域,充分表明毒死蜱对土壤真菌群落结构影响迅速且持久(见图3b)。毒死蜱处理样品细菌群落结构只在试验前30天与对照相比明显不同,60天时已经恢复对照水平(见图2a),同时主成分分析图上,毒死蜱处理样品与对照也越来越靠近,最后聚在一起(见图3a),说明毒死蜱对土壤细菌群落结构影响短暂。最后,获得了9个典型的ERIC型毒死蜱降解菌株。  相似文献   

2.
植物病原菌在生态系统功能中发挥重要作用。但在全球变化背景下,长期氮沉降如何影响植物病原菌群落尚未得到充分研究。因此,在大兴安岭兴安落叶松林进行了原位氮添加试验,共设置了4个氮添加梯度。2021年7月,采集了土壤、植物根系和叶片样品。利用16SrRNA和18SrRNA测序技术,探讨氮添加对土壤和植物共生病原菌群落的影响及其潜在机制。结果表明:氮添加显著增加了叶片细菌和真菌病原菌多样性,降低了土壤细菌病原菌多样性;氮添加引起根际和根系内生真菌病原菌群落结构发生了显著变化,但未显著改变土壤、根系和叶片细菌病原菌群落结构。冗余分析表明,土壤pH、NO-3-N、MBN和MBC是影响土壤和植物细菌和真菌病原菌群落结构的重要环境因子。基于上述,氮添加可能通过改变土壤性质,进而影响土壤和植物病原菌群落结构。  相似文献   

3.
探究烤鸭储存过程中菌群的变化,为延长其贮存期奠定理论基础.用酚、氯仿、异戊醇法提取烤鸭肉中细菌的基因组DNA,PCR扩增16SRNAV3区,用DGGE电泳技术分析菌群结构的变化情况,然后用Bionumerics软件对DGGE分子指纹图谱进行烤鸭肉菌群结构相似性分析.PCR结果表明,成功扩增了细菌基因组DNA,为230bp;DGGE实验结果表明,DGGE分子指纹图谱上条带存在显著差异;用bionumberics软件分析,发现样本相似度不断变化,表明在储存过程中,烤鸭肉菌群结构发生了变化.该研究为延长烤鸭肉保质期提供理论参考依据.  相似文献   

4.
采用玻璃珠法从高温堆肥样品中进行了微生物总DNA的提取,以细菌16S rRNA基因 V3区通用引物进行了PCR扩增,随后用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对其微生物多样性进行评估.结果表明,玻璃珠法能够快速、有效地获得高质量的堆肥微生物总DNA,所得的DNA分子片段在15kb以上,使用细菌16S rRNA 基因通用引物(27F和1492R)对总DNA进行PCR扩增,获得了近全长的16S rDNA序列(约1.5kb);DGGE分析结果表明,用该方法提取到的DNA种类较为丰富,多样性较好,能够进一步应用于群落结构分析.因此,玻璃珠法提取的DNA可以用于堆肥微生物的分子生态学研究及微生物群落结构分析.  相似文献   

5.
目的:分离筛选出高效降解毒死蜱菌株,明确其生物学分类地位,并优化其降解条件.方法:采取平板划线和摇瓶复筛法从农药厂土壤样品中分离得到高效降解毒死蜱菌株,并通过16S rRNA序列测定和同源性分析对其进行鉴定;运用HPLC法检测降解菌株对毒死蜱的降解效果,研究其在不同培养基、接种量、温度及pH条件下的降解能力.结果:从农药厂土壤样品中筛选得到一株能够以毒死蜱为唯一碳源生长的高效降解菌株OP7,经16S rRNA基因序列聚类分析,将其初步鉴定为粪产碱杆菌(Alcaligenes faecalis).进一步的降解条件优化结果显示,菌株OP7降解毒死蜱的最佳培养基是10%LB、最适接种量为3%(v/v)、最适温度为35℃、最适初始pH为9.0.结论:本研究结果表明菌株OP7有望成为新的菌种资源并应用于环境中毒死蜱污染物的生物修复.  相似文献   

6.
微生物是湿地生态系统中重要的生命体,其群落结构组成及其变化在一定程度上反映了湿地的质量及健全性,本研究选取黄河三门峡段青龙坝和天鹅湖采样点,采用平板培养法对湿地微生物群落结构的季节变化和空间变化进行研究,结果表明,湿地微生物物种丰富度高,细菌占绝对优势,放线菌次之,真菌最少,湿地微生物群落结构季节变化较为明显;根据平板数量优势分离出四株优势菌,初步判定Q-2菌株与芽孢杆菌属分类地位相近;四环素敏感性测定结果显示,湿地微生物在低浓度四环素暴露下生长受到明显抑制。  相似文献   

7.
通过分析湖南雪峰天麻种植过程中"烂窖"真菌群落组成,探究"烂窖"与真菌的关系.提取"烂窖"天麻的真菌总DNA,利用高通量测序和生物信息学分析等方法进行研究.结果表明:烂窖天麻中的主要真菌属为Candida、Cyberlindnera、Cladophialophora、Leptodontidium、Trichoderma和Trichosporon等,大部分为林地土壤中的优势种群或者是植物内生真菌;从不同样品的真菌群落丰度的差异分析结果可知,烂窖组与正常组并无显著差异(p>0.05).因此,2017年夏秋季节,在湖南雪峰山发生较为严重的天麻"烂窖",可能是由于其高温高湿天气造成.  相似文献   

8.
酸奶在储存过程中菌群结构变化研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
为了探究酸奶储存过程中微生物菌群结构的变化,为其长期贮存奠定理论基础.采用酚/氯仿法抽提细菌基因组DNA,以此作为PCR反应的模板,进行16S rDNA基因有效扩增,并将PCR扩增产物进行DGGE电泳.用Bionumerics软件对DGGE分子指纹图谱进行舌苔菌群结构相似性分析.实验结果表明,采用该方法成功地扩增出16S rDNA V3区片段,为230 bp.DGGE分子指纹图谱结果表明,1、2号酸奶样品高相似性为93%,1-3号与4-7号的相似仅为6%,表明酸奶贮存过程中,菌群结构发生了变化.  相似文献   

9.
为探究4种落叶果树土壤根际真核生物结构多样性,对石榴、桃树、银杏、樱桃土壤根际真核生物结构的多样性进行测序、分析。共得到2 368个OTUs,银杏样品的辛普森指数相对较低,香农指数相对较高,显示该样品群落多样性相对较高,银杏样品的ACE指数和Chaol指数都比其他样品高,表明银杏样品群落丰富度相对较高。在属水平上,石榴样品真菌群落有4个真菌优势菌属,主要是毛壳菌属(18.68%)和镰刀菌属(6.77%)。桃树样品真菌群落有5个真菌优势菌属,主要是镰刀菌属(8.87%)和毛壳菌属(7.00%)。樱桃样品真菌群落有6个真菌优势菌属,主要是毛壳菌属(22.66%)、镰刀菌属(15.91%)及被孢霉属(11.16%)。银杏样品真菌群落有7个真菌优势菌属,主要是毛壳菌属(9.08%)和Parastagonospora(5.83%)。4种果树样品的优势类群主要是真菌,不同果树样品根际土壤真菌群落差异较大。  相似文献   

10.
基于高通量测序的连作百合土壤细菌群落多样性研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
为了揭示连作对龙牙百合和铁炮百合根际土壤细菌群落结构和多样性的影响,本文采用高通量测序技术对连作2年、正茬的龙牙百合和铁炮百合根际土壤细菌群落进行16SrDNA基因V3+V4区域测序。结果显示:4个百合根际土壤样品中的有效序列注释为14068个操作分类单元(OTUs)。α多样性指数表明,连作提高了龙牙百合根际土壤细菌群落的丰度和多样性,降低了铁炮百合根际土壤细菌群落的丰度和多样性。β多样性分析表明,连作、正茬的龙牙百合和铁炮百合之间的根际土壤细菌群落多样性差异相对较大。细菌在门、属水平的相对丰度气泡图分析表明,龙牙百合和铁炮百合的根际土壤细菌群落优势菌门都主要有变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门。伯克霍尔德菌属、玫瑰弯菌属、芽单胞菌属、未命名Chloroflexi_bacterium属分别是正茬、连作2年的龙牙百合和铁炮百合根际土壤细菌群落的最优势菌属。连作2年后变形菌门、拟杆菌门菌群丰度的下降以及绿弯菌门菌群丰度的升高可能是铁炮百合更耐连作的原因,连作2年后变形菌门、拟杆菌门菌群丰度的升高以及酸杆菌门、放线菌门菌群丰度的下降可能是龙牙百合不耐连作的原因。研究结果对揭示百合连作障碍形成的原因具有一定参考价值。  相似文献   

11.
研究目的:研究化学肥料和有机肥处理条件下,茶园酸性土壤细菌和古菌群落结构,以及氮素转化相关功能酶基因丰度的时间变化规律。创新要点:研究肥料、土壤温度及土壤含水量对茶园酸性土壤细菌和古菌群落结构,以及氮素转化相关功能酶基因丰度的影响。研究方法:应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析茶园酸性土壤中细菌和古菌群落结构随时间的变化规律,应用荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术,研究茶园酸性土壤细菌、古菌、硝化作用功能酶基因(细菌和古菌amoA基因)和细菌反硝化作用功能酶基因(narG、nirK、nirS和nosZ基因)丰度的时间变化规律。重要结论:茶园土壤细菌和古菌群落结构受到肥料的影响,并随着取样时间有显著的变化。细菌、古菌和古菌的amoA基因的丰度在7月份最小,而细菌的amoA基因和反硝化作用功能酶基因(除nirK基因)的丰度在9月份最小。有机肥处理增加了细菌、古菌和氮素转化相关功能酶基因的丰度,但化学肥料的施用对菌群及功能酶基因丰度的影响较小。土壤温度显著影响了土壤细菌和古菌的群落结构。土壤含水量与细菌反硝化作用功能酶基因有显著的相关性。土壤有机碳含量与细菌、古菌及功能酶基因丰度之间有显著的相关性。  相似文献   

12.
《湘南学院学报》2017,(2):35-40
目的:对衡阳市区公共场所的秋季空气微生物(细菌和真菌)进行采样和分析,了解衡阳市空气微生物的群落结构和生态分布.方法:采用自然沉降法,分别在2014年10月10日、20日、30日,分上、中、下午三个时段对交通枢纽区、公园绿地区和文教区三个功能区,按照GBT18204.3-2013,对细菌和真菌进行采集和培养.结果:衡阳市10月份空气细菌菌落数为3116 CFU/m3、真菌菌落数为1984 CFU/m3、真菌菌落数为1984 CFU/m3、微生物总数为5101 CFU/m3、微生物总数为5101 CFU/m3.交通枢纽的空气微生物数量明显高于公园绿地和文教区.10月中旬的空气微生物含量高于上、下旬.同一天的空气微生物含量,下午高于上、中午.结论:衡阳市10月份的空气微生物污染为微污染,且在不同功能区的群落结构和生态分布不同.  相似文献   

13.
峨眉山珙桐根际和非根际土壤微生物的初步研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
以四川峨眉山珙桐林为研究对象,选取珙桐林珙桐根际和非根际两种土壤样品,分别进行微生物的分离、测数,并根据菌株形态、培养特征和生理生化特性等,对根际和非根际土壤中的细菌、放线菌和真菌进行了初步鉴定.结果表明:从珙桐根际和非根际土壤中共得到细菌菌株85株,分属于9个属;放线菌菌株28株,分属于2个属;真菌菌株13株,分属于5个属.同一地区珙桐根际和非根际土壤中,珙桐根际土壤中的微生物的总数以及细菌、放线菌和真菌数量均低于非根际土壤.  相似文献   

14.
不同肥料处理下茶园土壤细菌和古菌群落的时间变化研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
研究目的:研究化学肥料和有机肥处理条件下,茶园酸性土壤细菌和古菌群落结构,以及氮素转化相关功能酶基因丰度的时间变化规律。 创新要点:研究肥料、土壤温度及土壤含水量对茶园酸性土壤细菌和古菌群落结构,以及氮素转化相关功能酶基因丰度的影响。 研究方法:应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析茶园酸性土壤中细菌和古菌群落结构随时间的变化规律,应用荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术,研究茶园酸性土壤细菌、古菌、硝化作用功能酶基因(细菌和古菌amod基因)和细菌反硝化作用功能酶基因(narG、nirK、nirS和nosZ基因)丰度的时间变化规律。 重要结论:茶园土壤细菌和古菌群落结构受到肥料的影响,并随着取样时间有显著的变化。细菌、古菌和古菌的amoA基因的丰度在7月份最小,而细菌的amoA基因和反硝化作用功能酶基因(除nirK基因)的丰度在9月份最小。有机肥处理增加了细菌、古菌和氮素转化相关功能酶基因的丰度,但化学肥料的施用对菌群及功能酶基因丰度的影响较小。土壤温度显著影响了土壤细菌和古菌的群落结构。土壤含水量与细菌反硝化作用功能酶基因有显著的相关性。土壤有机碳含量与细菌、古菌及功能酶基因丰度之间有显著的相关性。  相似文献   

15.
为探究银纳米颗粒和低温双重胁迫对人工湿地污水处理效果和微生物群落结构的影响,在实验室条件下搭建了中试规模的垂直流人工湿地以处理合成废水.通过测定人工湿地出水中氨氮(NH+4-N)、总氮(TN)、总磷(TP)、化学需氧量(COD)浓度以及湿地上下土壤层内微生物的多样性、丰富度和群落结构,分析人工湿地对污水的处理效果和土壤基质内微生物的变化情况.结果表明,湿地TN、NH+4-N去除率与温度的相关系数分别为0.463和0.692,呈显著正相关性.从暖季到冷季,银纳米粒子与低温双重胁迫使湿地下层土壤微生物多样性及丰富度降低,并改变了氨氧化古菌属、硫针菌属、厌氧粘细菌、假丝酵母菌属、硝化螺旋菌属和菌胶团等脱氮功能细菌的丰度,从而影响了人工湿地的污水处理效果,究其原因可能是特定微生物物种随季节发生了变化.  相似文献   

16.
调查了7种生境的土壤动物数量和群落组成,共获得土壤动物538只,隶属于3门7纲11目.分析表明:优势类群为蚁科和线虫,常见及较常见类群为鳞翅目、蚯蚓、鞘翅目、马陆、鳞翅目(蛹)、蛴螬、蜘蛛目、鼠妇,其余5类为稀有类群.土壤动物的个体数及类群数以城市道路绿地最多,废弃荒地最少,说明人为干扰较小的生境土壤动物的数量和类群数较多.多样性以河边人工灌丛沙地最高,菜地最低,这与河边人工灌丛沙地营养丰富,菜地施用化肥、农药有关.菜地与废弃荒地的相似性极高,说明其群落组成相同.  相似文献   

17.
目的应用PCR-DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis,变性梯度凝胶电泳)技术对孤独症家庭成员肠道微生物菌群结构进行研究.材料和方法提取粪便细菌总基因组DNA,PCR扩增细菌16S rDNA基因V3可变区,DGGE方法检测PCR产物.结果建立了孤独症家庭成员肠道菌群组成的DGGE指纹图谱,分析结果显示孤独症儿童肠道菌群结构的相似度为0.42-0.65,家庭内孤独症儿童与父母之间的相似度为0.42-0.68.结论 PCR-DGGE技术是一种快速有效的用于分析研究人体肠道菌群结构的技术.孤独症儿童肠道菌群结构与父母的相似度较高,提示生活环境对肠道菌群的组成有影响.  相似文献   

18.
为研究低浓度杀虫剂对土壤动物群落结构的影响,采用野外定点方法进行三种典型杀虫剂的喷施实验,对中小型土壤动物群落结构进行分析。结果表明低浓度杀虫剂使中小型土壤动物个体数和类群数减少,但减少幅度不大,低浓度杀虫剂对不同动物类群影响不同,使蜱螨目和弹尾目数量减少,鞘翅目和膜翅目蚂蚁数量增多;低浓度杀虫剂处理对土壤动物群落多样性指数影响不大,对群落垂直方向的表聚性影响也不明显。  相似文献   

19.
题目:改良型多介质土壤渗滤系统对甲鱼养殖废水的净化效果研究
  目的:通过向多介质土壤渗滤系统(MSL)的土壤层添加污泥,研究改进后的系统对工厂化甲鱼养殖废水的处理效果,分析系统内微生物群落的变化,以期部分揭示其可能的作用机理。
  创新点:工厂化甲鱼养殖废水排放量日益增大,且水体氨氮含量较高。目前市场上缺乏针对甲鱼养殖废水的处理技术,MSL系统对该废水的处理也未有报道。本文在 MSL 系统的基础上进行改良,并将其应用于甲鱼养殖废水处理上,提出一套有效的甲鱼养殖废水处理技术,并对 MSL 系统内微生物群落结构进行了分析。
  方法:向4套MSL小试装置中分别添加0%、5%、10%和20%污泥,研究其对工厂化甲鱼养殖废水的净化效果。试验中水质指标测定均按国家标准方法进行,系统内微生物群落结构采用聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)法测定。
  结论:MSL系统可有效地处理工厂化甲鱼养殖废水,向系统中添加20%污泥后处理效果更佳。添加20%污泥的系统内具有较高的硝化类细菌多样性和都较多的生物量。  相似文献   

20.
在印度巴伦布尔,喜马偕尔邦农业大学土壤学和水管理系的温室中,开展了一项试验,以研究施硅和不施硅土壤中铁和锰的互作效应。供试作物为水稻(RT—42),施锰(mnso4、7H2o)量为0,25mg/kg,施铁(Fes04、2H20)量为0,25,50mg/kg,施硅(NazSio3、5H20)量为0,200mg/kg。未施硅土壤,施锰25mg/kg与对照相比,增加了稻谷和稻草产量,而施锰50mg/kg与施25mg/kg相比则降低了产量。当用硅处理土壤时,施锰(?)0mg/kg未对水稻产量产生任何影响,然而在施铁情况下,硅处理的土壤中、施锰50mg/kg可增加水稻产量,甚至超过施锰25mg/kg处理,但在非硅处理土壤中,此种锰用量未对产量产生任何效应。硅处理土壤上的稻谷和稻草产量比非硅处理土壤上的高。铁和锰的吸收和浓度分别随铁锰的施用而降低。非硅处理土壤上水稻内铁和锰浓度以及对铁的吸收比硅处理的土壤高,而锰的吸收不受硅处理的影响。当施入更多的铁和锰时,根系对其吸持降低,而其向茎叶部的动运移则增加,而施入较多的锰或硅时,有较多的铁被根系保留,向茎叶部的运移则较少;施入较多的铁或硅时,有较多的锰被根系保留,向茎叶部的运移减少,达到分 拼时期,水稻对锰和铁的吸收分别为0.85和0.51mg盆,分蘖至开花期为7.27和4.85/mg盆,开花至成熟期为4.20和2.52mg/盆,达到时熟时,水稻吸收  相似文献   

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