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1.
苏筱娟 《中国科教创新导刊》2000,(11):32-33
即使在分离并搞清了每个基因的确切功能（ Herculean计划）之后,我们对人类基因组的了解也只有 3％,这绝非戏言。那么,剩余的 DNA有什么作用呢？ 简要地说,基因就是指导细胞蛋白质合成的 DNA序列模板。在人类细胞的冗长的 DNA螺旋中,大部分是不能编码蛋白质的 DNA序列,即非编码 DNA。那么它们为什么还会存在呢？很多研究人员认为这种大量的非编码 DNA无异于废物,因为它们既然没有生物在生存斗争中赖以获得帮助的蛋白质编码,它们就不可能是自然选择的结果。这就意味着这些构成基因组的主要部分并非是进化的产物,而仅仅… 相似文献
2.
以牛的ANGPTL1基因为研究对象,利用生物信息学方法,对牛的ANGPTL1基因进行了电子克隆和序列分析,并对推导出的ANGPTL1蛋白结构与性质进行了初步分析。结果表明,牛的ANGPTL1基因序列长为2576 bp,该基因的编码序列长为1 476 bp,编码492个氨基酸,编码序列的两翼有135 bp的5’非编码区和785 bp的3’非编码区。DNA序列的G+C百分含量为44.31%,A+T百分含量为55.69%。该基因的核苷酸序列与人、黑猩猩、鼠和狗ANGPTL1基因的cDNA序列的相似性分别为91%、90%、82%和93%。在氨基酸序列上与人、黑猩猩、鼠和狗的相似性分别为95%、95%、92%和95%。用氨基酸序列构建的进化树显示,在人、牛、黑猩猩、狗、褐鼠、原鸡几种动物中,牛与狗的亲缘关系最近。 相似文献
3.
在真核生物的生命活动过程中,只有占基因组DNA总量的10％-15％具有为氨基酸编码的功能,而其余的DNA序列没有编码功能。这些DNA包括基因之间的间隔区和内含子,中度重复序列和没有表型效应的转座子,高度重复序列,特别是占总DNA 1％-3％的卫星DNA。而且有些DNA序列都是非转录的,它们既不为氨基酸编码,义不能转录成RNA。这样人们就无法用已知基因的功能来解释真核基因组如此之大的DNA含量,这称为C值矛盾。 相似文献
4.
罗丹 《中国科教创新导刊》2003,(4)
人类基因组中最后一些碱基序列的绘制工作将于今年４月完成，接下来该做些什么呢？这个老话题日前再次被提出。前不久，美国国家人类基因组研究所（NHGRI）的代表在其总部马里兰州贝塞斯达召开了一次专家云集的专题研讨会，共同探讨了这一问题的答案。今年２月底，NHGRI发布实施了一项最新的基因组计划“DNA元件百科全书，简称EN－CODE计划。该计划的目标是定位和识别所有基因组元件，包括编码蛋白基因、非编码基因以及一项新的基因组计划目的在于搞清数百万DNA碱基序列的机能。如图所示的是某一基因的碱基序列。调节基因表达的元… 相似文献
5.
解廷月 《雁北师范学院学报》2006,22(5):46-50
由于真核生物基因组染色体上各种序列的组织和安排复杂,所以我们把果蝇染色体上顺次排列的DNA序列分成内含子和编码序列两类.分别用描述序列构成的四个信息参数,分析各类序列沿着染色体分布特征,并着重讨论染色体着丝粒及其周围区域的分布规律,并解释引起这些特征的原因.用线性拟合和多项式拟合分析染色体各类序列沿染色体的统计分布特征(学生t检验),分析各个参数的平均值在染色体不同区域的差别.果蝇染色体参数X值是由D1(碱基偏置)和D2(碱基关联)值共同决定的,但果蝇染色体的编码序列参数X分内含子序列相比,分布没有趋同性.显示出编码序列跟内含子序列染色体的分布不同. 相似文献
6.
合理建模非编码序列对正确识别DNA序列中的调控元件非常重要 .基于卡方统计检验 ,给出了选用Markovchain模型来模拟序列背景分布的原因及如何确定Markovchain阶数的方法 .卡方测试分析模拟数据发现它能有效地确定模型阶数 .选择分析啤酒酵母中 1 0类基因的上游序列集发现 :所有序列集至少具有一阶以上的上下文相关性 ,除 1组基因外 ,其余 9组数据集具有二阶或三阶的上下文相关性 .这说明用高阶Markovchain来建模背景序列比单碱基模型 (零阶 )更合理 相似文献
7.
对线粒体DNA序列可通过图形表示及计算曲线的散度均值来构造模糊论中的相似矩阵，基于这些，提出一种新的方法：用模糊聚类图论法中的Kruskal算法来进行系统进化树的重构，并选取了8个物种的线粒体DNA序列来说明此方法． 相似文献
8.
生命现象遗传信息的流向都遵循分子生物学中的“中心法则” ,即从DNA到RNA再到蛋白质。由于绝大多数真核生物基因和某些原核生物基因是断裂基因 ,即在基因的DNA序列中插有一些无编码意义的片段 ,编码序列称为外显子 ,非编码序列称为内含子。由于基因中内含子的存在 ,基因在表达时 ,遗传信息在mRNA水平有一个剪接过程 ,即去掉内含子 ,将外显子连接起来 ,最终产生一个有功能的成熟mRNA分子。1990年 ,Hirata等在酵母液泡膜H+-ATPase的a亚基 (VMA1)中首次发现了蛋白质自剪接现象。蛋白质自剪接是前体蛋白中间的某些区域被切除 ,剩余部… 相似文献
9.
网络和非官方媒体报道中＂被××＂结构是新的语言现象,本文从认知语言学的角度对这一现象进行探讨,指出汉语被动语态典型的结构和＂被××＂结构的相似和不同之处,在这个原型的基础上,指出＂被××＂结构的延伸含义：表示非自愿的强迫,表示怀疑和不满,表示事实没有发生这三个延伸语义。同时,这一语言现象的理解和使用时认知过程和概念化的结果,在概念化的过程中,已使用为基础的认知模型和语言使用者的百科知识起着重要的作用。 相似文献
10.
表观遗传学是研究没有DNA序列变化的可遗传的基因表达的改变。它主要通过DNA的甲基化、组蛋自修饰、染色质重塑和非编码RNA调控等方式控制基因表达。近年发现,一个等位基因被另外一个等位基因在转录水平上沉默的副突变现象可能包含有表观遗传性质的变化。遗传学和表观遗传学系统既相区别,又彼此影响,相辅相成,共同确保细胞的正常功能。 相似文献
11.
INTRODUCTION Genomic DNA sequence analysis using wide range of statistical methods (Torney et al., 1999; Bulmer, 1987; Luo et al., 1998; Nieselt-Struwe, 1997; Fickett et al., 1992; Buldyrev et al., 1998; Azbel, 1995) and various symmetry investigations (Findley et al., 1982; Hornos and Hornos, 1993; Bashford et al., 1997; Bhry et al., 1998; Forger and Sachse, 1998; Frappat et al., 1998) is an extremely important tool for extracting hidden information on the dynamic process of evolu… 相似文献
12.
13.
Namrata Iyer 《Resonance》2011,16(4):333-340
Non-coding DNA, once thought of as ‘junk’, represents a very large portion of an organism’s genome. However, recent research
has brought to lightmany functional elements present within non-coding DNA sequences and unravelled a fascinating array of
functions performed by these elements. These findings have highlighted the nature of the evolutionary forces that led to the
accumulation and retention of non-coding DNA. In this article, the various elements present within noncoding DNA, their functional
relevance to the cell and the changing perspective of the scientific community towards this so-called ‘junk’ DNA have been
described. 相似文献
14.
以含翻译起始密码子ATG的质粒pSⅪⅤⅥ Ⅹ3/4为转移载体,将多角体蛋白及切除部分5′和3′端的乙型肝炎核心抗原(HBcAg)基因同时插入粉纹夜蛾核型多角体病毒(TnNPV)基因组中,构建了形成多角体的重组毒株。该毒株能利用合成—多角体ⅪⅤ串联启动子,表达由截短的HBcAg序列及其上下游多接头与杆状病毒DNA部分序列组成的融合蛋白基因。SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳、Wcstern印迹与免疫电镜观察的结果表明,融合蛋白基因表达产物的分子量约20.5KD,与理论计算值相符,并保留了HBcAg的抗原性,亦能形成典型的HBcAg颗粒。组建含多克隆点及截去两端序列的HBcAg基因转移载体质粒,使编码多肽抗原的寡聚核苷酸易于克隆,以HBcAg融合蛋白方式在杆状病毒载体系统中表达,并能形成HBcAg为蛋白载体的抗原颗粒结构。 相似文献
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16.
根据GenBank发布的基因序列,设计PCR引物,分别从诸葛菜(Orychophragmus violaceus)的花瓣基因组DNA和cDNA克隆到查尔酮合成酶基因,并定名为OvCHS,序列已上传至NCBI数据库,登陆号为EF408918。序列分析表明,OvCHS基因的基因组全长为1263 bp,具一个75 bp的内含子,编码区全长为1188 bp,编码395个氨基酸。与模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)查尔酮合成酶基因AtCHS比较发现,两基因编码区有135个碱基不同,相似性为88.64%,氨基酸序列中仅16个氨基酸残基的差异,相似性达95.95%。 相似文献
17.
以龙竹和凤尾竹基因组DNA为模板,通过试验不同的退火温度、循环数、Mg2＋浓度及DMSO浓度,获得了16条龙竹和凤尾竹PpMADS1相似序列片段,并得出稳定扩增PpMADS1相似序列的条件.对获得的龙竹和凤尾竹PpMADS1相似序列进行序列分析,发现龙竹和凤尾竹PpMADS1相似序列可根据序列长度差异分成组I和组II,并对其推出的氨基酸序列进行分析,找到了保守的paleoAP1基序和KIII区保守的氨基酸残基,并据此认为龙竹和凤尾竹PpMADS1相似序列是AP1/SQUA亚家族成员. 相似文献
18.
Suboptimal alignments always reveal additional interesting biological features and have been successfully used to informally estimate the significance of an optimal alignment. Besides, traditional dynamic programming algorithms for sequence comparison require quadratic space, and hence are infeasible for long protein or DNA sequences. In this paper, a space-efficient sampling algorithm for computing suboptimal alignments is described. The algorithm uses a general gap model, where the cost associated with gaps is given by an affine score, and randomly selects an alignment according to the distribution of weights of all potential alignments. If x and y are two sequences with lengths n and m, respectively, then the space requirement of this algorithm is linear to the sum of n and m. Finally, an example illustrates the utility of the algorithm. 相似文献