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为了辅助siRNA的设计,从已发表文献中共收集到573个siRNA的实验数据,使用基于统计学习理论的支持向量机(SVM)方法,提取了siRNA序列的碱基对关联性(BBC)特征,然后使用十倍交叉验证方法,对siRNA沉默目标基因的效率进行了预测.结果表明,基于支持向量机,选用多项式核作为核函数的算法具有最高的AUC值(0.73,ROC曲线图)和最高的r值(0.43,Pearson相关系数分析),优于以前基于打分的算法.结果说明,在以后的siRNA的设计中应该更多关注碱基之间的关联信息. 相似文献
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《生物信息学》——打造精品课程的契机 总被引:1,自引:1,他引:0
本文针对生物信息学本科教学的国内外现状进行了分析,提出了目前是打造<生物信息学>精品课程的非常契机.笔者对如何打造精品课程提出了自己的看法,对教学中的教学方法、实验教学以及如何与现代教育技术相结合进行了初步的探索. 相似文献
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