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蒺藜苜蓿液泡膜H~+-ATPase A亚基cDNA的电子克隆与序列分析
引用本文:孙艳香,李平.蒺藜苜蓿液泡膜H~+-ATPase A亚基cDNA的电子克隆与序列分析[J].河北职业技术学院学报,2009(1).
作者姓名:孙艳香  李平
作者单位:廊坊师范学院;
基金项目:廊坊师范学院博士专项基金项目(LSZB2OO6O3)
摘    要:根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学的方法,以大豆液泡膜H+-ATPase A亚基基因cDNA序列为信息探针,通过电子克隆得到了蒺藜苜蓿液泡膜H+-ATPase A亚基cDNA,命名为MtVHA-A。该cD-NA长2750bp,其中含5’非翻译区220bp,开放阅读框1875bp,3’非翻译区655bp,其推断的编码产物由624个氨基酸组成,理论分子量为69kDa,与蜜柑、番茄、拟南芥、棉花等植物中液泡膜H+-ATPase A亚基氨基酸序列同源性高达90%以上,且有很高的功能区段保守性。

关 键 词:蒺藜苜蓿  液泡膜H+-ATPase  A亚基  MtVHA-A  

In Silico Cloning and Analysis of Tonoplast H~+-ATPase A subunit cDNA in Medicago truncatula
SUN Yan-xiang LI Ping.In Silico Cloning and Analysis of Tonoplast H~+-ATPase A subunit cDNA in Medicago truncatula[J].Journal of Hebei Polytechnic,2009(1).
Authors:SUN Yan-xiang LI Ping
Abstract:In the present paper,a tonoplast H+ATPase A subunit cDNA,named MtVHA-A was cloned in Medicago truncatula by EST in silico cloning.The cDNA contained 2750 bp with 5'-UTR of 220 bp,ORF region of 1875 bp,3'-UTR of 655 bp,and encoded a 69 kDa protein with 624 amino acid.The deduced amino acid sequence showed more than 90% similarity to homologues from other plants such as Citrus unshiu,Lycopersicon esculentum,Arabidopsis thaliana and Gossypium hirsutum,and highly conserved functional domains of the gene class.
Keywords:medicago truncatula  tonoplast H+-ATPase A subunit  MtVHA-A  
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