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BEREZHNOY Andrey Yu SHCKORBATOV Yuriy G. HISANORI Kiryu 《Journal of Zhejiang University. Science. B》2006,7(12)
INTRODUCTION It is well known that the physical properties, namely DNA strands interaction in promoter are connected with their activity. As it was established the two promoter regions ?35 and ?10 are the most important for the promoter functioning, all bases in the ?35 (TTGACA) and ?10 (TATAAT) hexamers were highly conserved (Harley and Reynolds, 1987; Hawley and McClure, 1983). The functional impor- tance of these sequences was proved in many inves- tigations (Record et al., 199… 相似文献
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The energy of interaction between complementary nucleotides in promoter sequences of E. coli was calculated and visualized. The graphic method for presentation of energy properties of promoter sequences was elaborated on. Data obtained indicated that energy distribution through the length of promoter sequence results in picture with minima at -35, -8 and ＋7 regions corresponding to areas with elevated AT （adenine-thymine） content. The most important difference from the random sequences area is related to -8. Four promoter groups and their energy properties were revealed. The promoters with minimal and maximal energy of interaction between complementary nucleotides have low strengths, the strongest promoters correspond to promoter clusters characterized by intermediate energy values. 相似文献
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INTRODUCTION Genomic DNA sequence analysis using wide range of statistical methods (Torney et al., 1999; Bulmer, 1987; Luo et al., 1998; Nieselt-Struwe, 1997; Fickett et al., 1992; Buldyrev et al., 1998; Azbel, 1995) and various symmetry investigations (Findley et al., 1982; Hornos and Hornos, 1993; Bashford et al., 1997; Bhry et al., 1998; Forger and Sachse, 1998; Frappat et al., 1998) is an extremely important tool for extracting hidden information on the dynamic process of evolu… 相似文献
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介绍了植物对病原茵入侵的反应和DNA微阵列(DNA microarray)的原理．综述了DNA microarray在植物与病原茵互作过程中的应用,包括潜在的防御相关基因、基因聚类及其启动子区顺式元件的鉴定,研究不同信号途径之间的相互作用．对植物防御反应机制,包括R基因表达、防御信号转导基因、防御反应及信号分子等方面进行了阐释．提出该技术存在的问题、解决策略和应用展望． 相似文献
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以含翻译起始密码子ATG的质粒pSⅪⅤⅥ Ⅹ3/4为转移载体,将多角体蛋白及切除部分5′和3′端的乙型肝炎核心抗原(HBcAg)基因同时插入粉纹夜蛾核型多角体病毒(TnNPV)基因组中,构建了形成多角体的重组毒株。该毒株能利用合成—多角体ⅪⅤ串联启动子,表达由截短的HBcAg序列及其上下游多接头与杆状病毒DNA部分序列组成的融合蛋白基因。SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳、Wcstern印迹与免疫电镜观察的结果表明,融合蛋白基因表达产物的分子量约20.5KD,与理论计算值相符,并保留了HBcAg的抗原性,亦能形成典型的HBcAg颗粒。组建含多克隆点及截去两端序列的HBcAg基因转移载体质粒,使编码多肽抗原的寡聚核苷酸易于克隆,以HBcAg融合蛋白方式在杆状病毒载体系统中表达,并能形成HBcAg为蛋白载体的抗原颗粒结构。 相似文献
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在pH=7.40的Tris-HCl缓冲溶液中,采用荧光光谱法和粘度法研究了8-羟基喹啉（HQ）与鲱鱼精DNA的作用方式.用摩尔比法确定了HQ与DNA的结合比为12∶1.通过热力学研究得出,在27℃时HQ与DNA之间相互作用的Kφ27℃=3.844×105L/mol,热力学函数ΔrHφm=-5.08×104J/mol,ΔrGφm 300.15K=-3.2×104J/mol,ΔrSφm=-62.6 J/（mol.K）.结果显示该反应为焓驱动.实验表明HQ与DNA的作用方式为部分嵌插与静电作用方式. 相似文献
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蔡从中 《重庆大学学报(英文版)》2003,2(1)
1. Introduction Experimental studies have shown that a DNA molecule with alternating pyrimidine-purine sequence can adopt a left-handed, double-helical Z-DNA conformation [1,2]. Such structural changes of DNA occur as a consequence of environmental conditions such as at salt concentration above 4 mol/L NaCl [1,2] or through certain chemical modification such as methylation [1] or bromination [2,3] of bases at physiological conditions. These structural changes and chemical modifications … 相似文献
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邵爽 《浙江教育学院学报》2006,(1):1-5
用荧光光谱法研究水溶液中氧氟沙星与小牛胸腺DNA的结合作用，测定了两个不同温度下氧氟沙星与DNA的结合常数KA和结合位点数n，探讨了其荧光猝灭机制；根据热力学参数确定了氧氟沙星与DNA之间的作用力以静电作用为主；进一步考察了二种金属离子及盐效应对该结合反应的影响． 相似文献
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介绍了DNA与识别分子相互作用电化学研究的原理,对DNA与各种类型的分子相互作用的电化学研究等方面的最新进展进行了评述。 相似文献
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Density function M06 method has been used to optimize the geometries of camptothecin-cytosine at 6-31+G* basis.Finally, thirteen stabilized complexes have been obtained.Theories of atoms in molecules (AIM) and natural bond orbital (NBO) have been utilized to investigate the hydrogen bonds involved in all the complexes.The interaction energies of all the complexes are corrected by basis set superposition error (BSSE).By the analysis of complexes interaction energy, charge density, second-order interaction energies E(2), it is indicated that the complex 6 is the most stable structure. 相似文献
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合成了N-（3-氨基丙基）苄胺-丹皮酚铜配合物并进行表征,用电子吸收光谱及荧光光谱法研究了铜配合物、洛美沙星以及DNA之间的相互作用,探讨了三者之间相互的作用方式,发现该铜配合物与DNA以及洛美沙星-DNA复合物之间很容易发生插入作用。 相似文献
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杨淋 《蒙自师范高等专科学校学报》1991,(2)
EDSS在0—10GHz频率范围内观察到水解DNA的微波共振吸收,这一尚有争议的结果引起许多学者浓厚的兴趣,并在理论和实验方面做了大量的工作。本文从理论上详细地研究了水解DNA的微波共振吸收问题。然后考虑DNA和抗衡离子的长程库仑作用及界面影响,计入水合层的阻尼作用及有关的耦合,自然地计算了DNA、水合层以及它们之间的静电相互作用,提出了一个更符合实际的模型,得到DNA和第一水合层系统的二阶非线性微分方程。在实际出现的小振幅振动下,方程中的非线性项为小项,用摄动法求解微分方程,计算出各级近似下解的具体形式。当外加电磁场在系统上后,得到了一系列的共振频率,许多与Van Zandt等人用局部有效场近似方法的结果一致,同时尚预言了一些新的共振频率。我们的模型与EDSS所讨论的对象相同,但计算结果没有他们所观察到的共振频率,故我们的工作似乎不支持Edwards等人的工作。 相似文献
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理论运用密度泛函（DFT）方法,计算四个取代基型钌（II）多吡啶配合物[Ru（phen）2（6-R—dppz）]^2＋（R—OH,-NO2）和[Ru（phen）2（7-R—dppz）]^2＋（R=-F,-CH3）．合理解释了在主配体（dppz）上引入强拉电子的取代基（-F,-NO2）,比引入推电子取代基（-OH,-CH3）有利于提高配合物与DNA键合的能力．这是通过降低最低空轨道LUMO及相近的最低空轨道（LUMO＋X）的能量及其插入配体的布居调控的． 相似文献
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高等植物启动子功能和结构研究进展 总被引：2，自引：0，他引：2
启动子是植物基因工程中一个重要的研究对象，文章简述了启动子的定义、分类和启动子的研究策略。并着重从组成型启动子、组织特异型启动子和诱导型启动子3个方面介绍了它们的功能和结构的研究现状。提出了植物基因工程中启动子研究存在的问题与展望。 相似文献