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PPII螺旋结构是一种重要的蛋白质二级结构类型。本文首先从2303条高质量的多肽链中提取出PPII螺旋结构形成结构数据集,然后对结构数据集进行了统计分析。统计表明:PPII螺旋结构是种稀有的蛋白质二级结构类型,约占数据集的2.1%,但是PPII螺旋结构经常出现在多肽链中,大约50%的蛋白链中至少包含一条PPII螺旋结构;PPII螺旋结构比较短,超过90%的PPII螺旋结构只有4个或5个氨基酸残基;PPII螺旋结构的长度分布与310螺旋很相似;PPII螺旋结构最偏爱Pro残基,但不是每条PPII螺旋结构都必须包含Pro残基,不过对于长度较长的PPII螺旋结构,一般至少包含一个Pro残基;另外,残基Gln,Thr,Ser和Leu在PPII螺旋结构中也较常出现;极性残基不常出现在PPII螺旋结构中;残基Gly最不倾向于PPII螺旋结构。 相似文献
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基于改进编码的多聚脯氨酸二型结构预测 总被引：1，自引：0，他引：1
目前使用机器学习方法对稀有的PPII二级结构进行预测工作还比较少见。本文在分析数据集的特征基础之上,采用加强局部信息的改进编码方法,并使用生物信息学中常用的BP神经网络来预测PPII二级结构。通过对不同输入窗口长度与不同隐层节点数的神经网络进行训练和测试,得出在输入窗口长度为5个氨基酸残基和隐结点数为8时PPII螺旋结构能够被很好地预测出来,此时的预测敏感度为82.5%。 相似文献
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蛋白质是一种生物大分子,由20多种氨基酸以肽键连接成多肽链.多肽链上氨基酸的组成和排列方式称为蛋白质的一级结构.不同蛋白质肽链的长度不同,一级结构也不同.肽链在空间卷曲折叠成为特定的三维空间结构,包括二级结构和三级结构二个主要层次. 相似文献
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为了提高蛋白质二级结构预测的效率,对具有完全学习策略的量子行为粒子群（CLQPSO）算法进行了研究,实现了一种融合混沌优化与完全学习策略的量子行为粒子群算法;通过在粒子群进化过程中对收缩扩张因子和局部吸引子的混沌优化,提高了敛速和精度．基于统一计算设备架构（CUDA ）,利用GPU 的并行计算能力,将该算法并行化并应用到蛋白质二级结构预测中．实验表明：相比串行实现,该并行算法在对长度较短的残基序列进行蛋白质二级结构预测时,加速比可超过40． 相似文献
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<正> 例1 人体免疫球蛋白中,1gG(一种免疫球蛋白)由4条肽链构成,共有764个氨基酸,则该蛋白质分子中至少含有游离氨基和羧基数分别是A.764和764 B.760和760C.762和762 D.4和4解析该题应强调对“至少”和“游离”二词的理解。一个氨基酸分子“至少”有一个氨基和一个羧基,R 基中是否有氨基和羧基不予考虑。不参与脱水缩合的氨基和羧基方可称为“游离”的氨基和羧基,参与了脱水缩合的氨基和羧基不可称为“游离”的氨基和羧基。如此,n 个氨基酸(至少有 n 个氨基和 n个羧基)脱水缩合形成一条多肽链时,形成 n-1个肽键,脱掉n-1个水分子,用掉 n-1个氨基和 n-1个羧基,剩余1个氨基和1个羧基,故1条多肽链至少含有1个游离的氨基和1 相似文献
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多聚核糖体现象是我们比较熟悉的，在蛋白质合成过程中，同一条mRNA分子能够被多个核糖体结合，同时合成若干条蛋白质多肽链，结合在同一条mRNA上的核糖体就称为多聚核糖体． 相似文献
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一、有关蛋白质相对分子质量的计算例1组成生物体某蛋白质的20种氨基酸的平均相对分子质量为128,一条含有100个肽键的多肽链的分子量为多少?解析在解答这类问题时,所必须明确的基本关系式是:蛋白质的相对分子质量=氨基酸数×氨基酸的平均相对分子质量-脱水数×18(水的相对分子质量)本题中多肽链含有100个肽键,则其中氨基酸数为:100+1=101,肽键数为100,脱水数也为100,则依上述关系式得蛋白质分子量=101×128-100×18=11128。变式1组成生物体某蛋白质的20种氨基酸的平均相对分子质量为128,则由100个氨基酸构成的含2条多肽链的蛋白质,其分子量… 相似文献
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李春香 《唐山师范学院学报》1996,(Z1)
酶是生物催化剂,是生物有机体产生的一种特殊蛋白质,由酶蛋白和辅因子两部分组成。酶的结构通常有: 1.一级结构:指肽链上的氨基酸序列,各氨基酸残基的肽键C—N键共价相连。 2.二级结构:是主链上有规律的结构单元,是近距离的原子间的相互作用螺旋折叠。这些结构单元全被氢键所稳定。 3.结构域:大的蛋白质是由独立的、分开的折叠的球状单位,含有较小的重复的超二级结构,完成特殊的功能。各结构域间有一条裂缝,往往是底物的入口,产物的出口,且 相似文献