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1.
家驴具有很大的市场开发潜力和价值.本研究通过生物信息学技术分析了家驴CSN3基因的序列特征,为家驴向肉用或乳用方向选育初步提供一定的分子依据.经分析研究发现家驴CSN3基因共包含五个外显子和四个内含子.初始转录物的前81nt为5'UTR区,后205nt为3'UTR区,中间的549nt为CDS区.整个CDS区翻译出182个氨基酸构成的多肽.家驴的κ酪蛋白中的氨基酸以脯氨酸所占的比例最高(14.286%),其次为缬氨酸(10.989%),最低的为半胱氨酸、色氨酸和甘氨酸(所占比例都为0.5495%).各物种κ酪蛋白氨基酸序列间每个位点氨基酸替代数的平均值的大小能够较好反映物种间亲缘关系的远近.κ酪蛋白氨基酸序列能够很好地反映物种之间的亲缘关系,适合用于系统发育分析. 相似文献
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在我国,家驴及驴产品具有很大的市场开发潜力和价值.本研究通过生物信息学技术分析了家驴朊蛋白基因PRNP的序列特征,为家驴向肉用方向进行抗病选育提供一定的分子依据.经分析研究发现家驴PRNP基因CDS区翻译出255个氨基酸构成的多肽.家驴的朊蛋白中的氨基酸以甘氨酸所占的比例最高(18.43%),其次为缬氨酸(8.63%),最低的为半胱氨酸(1.18%).对15条家驴PRNP基因的CDS区序列进行比对时只发现了C153T、T237C和G354C三个突变,并且这三个突变均为沉默突变.家驴朊蛋白的编码存在明显的密码子使用偏好现象.另外,我们重新界定了家驴朊蛋白各区块的具体大小和位置. 相似文献
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蕲蛇酶具有降解纤维蛋白原、降低血粘度及改善微循环等作用,对脑梗塞有治疗作用组织型纤溶酶原激活物(1-PA)及纤溶酶原激活物抑制物(PAI)是反映机体纤溶系统功能状况的两个重要指标。本研究通过测定脑梗塞患者蕲蛇酶治疗前后血浆t-PA、PAI活性来了解该药对机体纤溶系统的影响。1 临床资料1.1 一般资料 全部病例按全国第二届脑血管病会议通过的诊断标准诊断为急性脑梗塞患 相似文献
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二甲亚砜对黄粉虫NAGase活力的影响 总被引：2，自引：0，他引：2
研究二甲亚砜(DMSO)对黄粉虫(Tenebrio molitorLinnaeus)N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶活力(NAGase)的影响.结果表明:该酶的剩余活力随着二甲亚砜浓度增大而呈指数下降,导致酶活力丧失50%的二甲亚砜的浓度(抑制半衰期,IC50)为5%,说明二甲亚砜对黄粉虫NA-Gase有明显的失活作用.该酶的失活过程属于可逆过程,抑制机理表现为混合型抑制类型,进一步测定游离酶(E)和底物络合物(ES)与二甲亚砜的结合常数(KI和KIS),分别为6.12%和26.2%,KI相似文献
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《大连大学学报》2015,(6):60-65
从假交替单胞菌(Pseudoalteromonas sp.DL-6)中克隆低温几丁质酶chiA基因(Gen Bank登录号KF234015)。该序列全长3160个核苷酸,编码1053个氨基酸,预测相对分子质量113.5 KDa,等电点(pI)4.49,命名为chiA。功能结构域分析显示其编码区包含信号肽、2个几丁质结合域、2个成人多囊肾病结构域、18家族几丁质酶催化域与18家族糖苷水解酶C端部分序列。利用Discovery Studio平台以同源建模的方法构建低温几丁质酶chi A的催化域三维结构模型,并对其进行结构优化和评估,Ramachandram图谱检测和Verify-3D评估显示模拟出的模型结构合理,整体的相容性较为可信。本结果拟为后期低温几丁质酶chiA的催化机理研究提供理论依据。 相似文献
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根据GenBank发布的基因序列,设计PCR引物,分别从诸葛菜(Orychophragmus violaceus)的花瓣基因组DNA和cDNA克隆到查尔酮合成酶基因,并定名为OvCHS,序列已上传至NCBI数据库,登陆号为EF408918。序列分析表明,OvCHS基因的基因组全长为1263 bp,具一个75 bp的内含子,编码区全长为1188 bp,编码395个氨基酸。与模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)查尔酮合成酶基因AtCHS比较发现,两基因编码区有135个碱基不同,相似性为88.64%,氨基酸序列中仅16个氨基酸残基的差异,相似性达95.95%。 相似文献
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本文对25例用尿激酶、15例用去纤酶溶栓治疗的急性心肌梗塞患者体内的组织型纤溶酶原激活剂(tissue Plasminogen Activator,t-PA)的含量、活性及纤溶酶原激活剂抑制物(Plasminogen Activator Inhibitor,PAI)的活性在治疗前后的改变进行了动态观察。结果表明:(1)尿激酶可以显著地提高t-PA的活性,降低PAI的活性,这种作用在用药后0.5h最明显,维持4h左右,去纤酶则无此作用。(2)尿激酶组的再通率(76％)显著高于去纤酶组的再通率(20％),住院病死率12％,低于去纤酶组20％。两组的出血并发症相等,均为20％。提示:尿激酶可以有效地提高急性心肌梗塞患者的纤溶活性,去纤酶用于溶栓治疗可能无效。 相似文献
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珙桐rbcL基因的克隆与序列分析 总被引：1，自引：0，他引：1
根据已知植物rbcL基因设计引物,以珙桐叶片总DNA为模板,PCR扩增目的DNA片段,克隆入pDM19-T载体.阳性克隆鉴定后进行测序,序列分析结果表明:该基因片断长为1266 bp,包括1031 bp的编码区序列,编码343个氨基酸;其编码区氨基酸与烟草、菠菜、玉米、甘薯、拟南芥、水稻、葡萄、地钱和葡萄柚等9个物种的同源性94.13%以上,并构建了它们间的亲缘关系树.该基因片断的预测晶体结构与菠菜的最相近,推测Lys86、Lys60、Lys179等残基对酶的活性影响较大. 相似文献
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采用硫酸铵沉淀法从穿龙薯蓣分离纤溶酶,利用纤维平板法对分离的纤溶酶进行活性鉴定.结果表明从穿龙薯蓣能够分理出具有溶栓活性的纤溶酶,该酶在25～40℃范围内活性相对稳定,最适pH值为3.68,在pH4.0左右仍能保留大部分酶活. 相似文献
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《大连大学学报》2016,(6):66-70
采用生化手段对香螺(湿重:136187 g)肌肉中水分、粗蛋白、灰分、粗脂肪含量及脂肪酸、氨基酸的组成与含量进行了检测与分析。结果表明:香螺肌肉一般营养成分中水分含量77.56%、粗蛋白含量60.52%(干)、灰分6.27%、粗脂肪7.29%。共检测到17种脂肪酸和17种氨基酸,其中,17种脂肪酸中含有5种饱和脂肪酸(SFA)和12种不饱和脂肪酸(UFA)。在不饱和脂肪酸中有4种单不饱和脂肪酸(MUFA)和8种多不饱和脂肪酸(PUFA),DHA和EPA的总量为18.2%。17种氨基酸中,谷氨酸(Glu)含量最高,占总量10.82%,其次依次为甘氨酸(Gly)、天冬氨酸(Asp)与精氨酸(Arg);色氨酸(Trp)含量最低占总量0.41%。呈味酸与必需氨基酸含量分别占氨基酸总量的54.33%和44.66%,必需氨基酸指数为63.89。综上,香螺为一种营养丰富、价值较高的海味佳品。 相似文献
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高丽枫 《赤峰学院学报(自然科学版)》2015,(1):17-18
D-二聚体(D-Dimer)是纤溶酶作用于交联蛋白的特异性分子标志物,血浆D-Dimer的含量增高与否可以反映凝血和纤溶系统的激活状况,也可以用来区分原发性和继发性纤溶亢进.D-Dimer的定量测定对于血栓性疾病、恶性的肿瘤性疾病、肝脏类的疾病、肾脏类的疾病等的早期发现、初步鉴别、治疗过程监测和预后的判断有着极其重要的临床价值,特别是在深静脉血栓(DVT)形成和肺栓塞(PE)形成的区别上起到了不可忽视的作用. 相似文献
12.
新城疫病毒(NDV)ND-xx08毒株经10 d龄SPF鸡胚增殖后,提取其基因组RNA并反转录成cDNA,用NDV F基因特异性引物,经PCR扩增后获得与F基因预期大小一致的DNA片段。将NDV F基因片段克隆到pMD18-T载体上,并进行EcoR I和Hind III双酶切鉴定和测序鉴定。结果显示,ND-xx08毒株F基因片段的长度为1 662 bp,共编码554个氨基酸,F蛋白的裂解位点为112R-R-Q-K-R-F117,是典型强毒株氨基酸序列结构。将NDV ND-xx08株F基因的47 bp到420 bp序列与新城疫病毒基因型I至基因型Ⅸ毒株的相同序列绘制病毒基因进化树,显示ND-xx08分离株属于基因Ⅶe型。将NDV ND-xx08株F全基因与国内外发表的23株NDV F基因核苷酸序列和氨基酸序列的同源性比较分析,结果表明,其核苷酸序列的同源性在82.7%~97.8%之间,氨基酸同源性在87.5%~97.7%之间。 相似文献
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灰斑古毒蛾核型多角体病毒几丁质酶基因及其分子进化 总被引：5，自引：0，他引：5
通过对构建的灰斑古毒蛾Orgyia ericae单粒包埋型核型多角体病毒(OrerSNPV)基因组DNA的EcoRI酶切片段质粒文库的测序分析,在EcoRI—J片段(6．4kb)中鉴定出了编码几丁质酶(ChiA)基因开放阅读框(ORF),chiA基因编码区由1695bp组成,编码564个氨基酸,预计蛋白质分子量为62kD。这也是首次在基因序列水平上研究OrerSNPV。将OrerSNPV ChiA氨基酸序列与其它已知的18种杆状病毒ChiA氨基酸序列联配比较,结果表明OrerSNPV与其它杆状病毒ChiA氨基酸有60．3—69．5％同源性,其中与BmNPV、CfDEFNPV和LdMNPV的同源性最高。根据氨基酸序列绘制的分子进化树表明杆状病毒chiA基因至少可以分为SlMNPV、GV和其它NPV三个分支,OrerSNPV与LdMNPV在进化树上关系最为接近。 相似文献
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《常熟理工学院学报》2016,(4)
为揭示沙塘鳢(Odontobutis)线粒体基因组特征,采用PCR扩增和测序的方法获得沙塘鳢(Odontobutis)线粒体基因组全序列.通过生物信息学软件(t RNAscan-SE、RNAfold)定位沙塘鳢线粒体基因组基因结构及预测t RNA和r RNA的二级结构.沙塘鳢线粒体基因组全长16 930 bp,结构组成和其他硬骨鱼基本一致,包括13个蛋白质编码基因,22个t RNA,2个r RNA和1个D-loop区.13个蛋白质编码基因中,除了CO1是以GTG作为起始密码子,ND6以TTA作为起始密码子以外,其余都以ATG起始.沙塘鳢线粒体基因的终止密码子有3种类型,分别为完全密码子TAA、不完全密码子TA和T.除了t RNASer(AGN)和t RNACys外,其余20个t RNA基因的二级结构都是典型的三叶草结构.识别了沙塘鳢终止序列区、中央保守区D、E、F和保守序列区CSB-1、CSB-2和CSB-3.比较沙塘鳢cytb基因序列与其他物种同源性发现,沙塘鳢与平头沙塘鳢的同源性最高(87.03%),河川沙塘鳢次之(83.57%),与人的同源性最低(70.64%).该研究结果可为深入探讨沙塘鳢属及塘鳢科鱼类的系统分类提供依据,更真实地反映了沙塘鳢的分类地位和进化关系. 相似文献
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里氏木霉液体发酵产生的粗纤溶酶液中含有许多的色素物质,这些色素物质在酶的分离提纯中会污染色谱分离填料,严重影响填料的分离度和使用寿命.选择D301和D296离子交换树脂、活性碳和高岭上作为脱色介质,对粗纤溶酶液进行脱色实验研究.实验结果表明,当树脂的反离子采用CI-1型时,D301和D296离子交换树脂可以用于粗纤溶酶液的脱色,按脱色过程对目标纤溶酶还有一定的提纯作用。 相似文献
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Ji-ye GAO Cui-lian YE Li-li ZHU Zhi-ying TIAN Zhi-bang YANG 《Journal of Zhejiang University. Science. B》2014,(9)
研究目的:对鸭疫里默氏杆菌的三磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)进行鉴定和生物学特征分析。创新要点:首次证实鸭疫里默氏杆菌具有GAPDH的同源体酶(RaGAPDH)是一种无信号肽和跨膜区的胞外蛋白酶,具有将3-磷酸甘油醛转化为1,3-二磷酸甘油酸的活性,可与纤维蛋白溶酶原及纤维蛋白原发生结合,推测该酶可能是鸭疫里默氏杆菌的一个新发现的毒力因子。研究方法:1.对分离自重庆、四川地区的鸭疫里默氏杆菌(表1)菌体细胞表面蛋白(图1a)和CZ2、SC12、YC1三株菌胞外蛋白(图1b)的GAPDH活性进行检测,对其编码基因进行PCR鉴定(图2)和克隆测序分析(图3);2.采用染色体步移技术获得CZ2的GAPDH编码基因进行原核表达(图4a和4c);3.以获得的具有活性的重组GAPDH为抗原,制备鼠原多克隆抗体并采用Western-blot方法对鸭疫里默氏杆菌的胞外分泌蛋白进行检测分析(图4b);4.采用固相配体结合试验检测RaGAPDH与纤维蛋白溶酶原、血纤维蛋白原、肌动蛋白和纤连蛋白的结合作用(图5)。重要结论:鸭疫里默氏杆菌具有三磷酸甘油醛脱氢酶同源体,具有GAPDH活性,能与纤维蛋白溶酶原和血纤维蛋白原结合,可能是其重要的毒力因子。 相似文献
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目的:研究慢性肾功能衰竭患者血浆脂蛋白(a)与纤溶活性的关系.方法:应用酶联免疫吸附法分别测定58例慢性肾功能衰竭患者及51名健康对照者的血浆脂蛋白(a)浓度,并以底物显色法测定其组织型纤溶酶原激活剂(tPA)及其抑制物(PAI)活性.结果:慢性肾功能衰竭患者血浆脂蛋白(a)浓度和PAI活性明显升高,tPA活性明显降低;脂蛋白(a)浓度与血浆尿素氮水平、PAI活性均呈正相关;脂蛋白(a)浓度与tPA活性呈负相关.结论:肾功能对血浆脂蛋白(a)浓度起一定的调节作用,脂蛋白(a)水平的升高与纤溶活性低下有关. 相似文献
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例题:已知某基因片段碱基排列如下:①—GGCCTGAAGAGAAGT—②—CCGGACTTCTCTTCA—,由它控制合成的多肽中含有“—脯氨酸—谷氨酸—谷氨酸—赖氨酸—”的氨基酸序列(密码子:脯氨酸:CCU、CCC、CCA、CCG;谷氨酸:GAA、GAG;赖氨酸:AAA、AAG;甘氨酸:GGU、GGC、GGA、GGG)。问:(1)翻译上述多肽的mRNA是由该基因的链转录的(①或②),此信使RNA的碱基排列顺序是。(2)若该基因由于一个碱基被置换而发生突变,所合成的多肽的氨基酸的排列顺序为“—脯氨酸—谷氨酸—甘氨酸—赖氨酸—”,写出转录并翻译此多肽的DNA单链的碱基… 相似文献
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以黄粉虫为材料,以N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶(NAGase,EC 3.2.1.52)为研究对象.考察了几种有机溶剂对NAGase活力的影响.结果表明:甲醇、乙醇、正丙醇、乙二醇和丙三醇对NAGase的作用均表现为低浓度时对酶有激活作用,随着浓度的升高,激活作用减弱并速转为抑制作用;N,N—二甲基甲酰胺(DMF)和二氧六环对酶的抑制作用呈现明显的浓度效应,随浓度增大酶活力迅速下降.进一步研究二氧六环的抑制作用动力学,结果表明:二氧六环对酶的抑制作用是可逆过程,抑制类型都表现为混合型抑制.测得二氧六环对游离酶的抑制常数K I为8.1%,对酶-底物络合物的抑制常数K IS为30.0%. 相似文献