大蹼铃蟾的线粒体基因组D—loop区序列分析     

张雁  韩毛振  罗学才  王晶晶 《巢湖师专学报》2013,(6):71-75

脊椎动物的线粒体DNA（mtDNA）是一段长度约为15—22Kb的环形片段,具有相对的保守性。D-loop区是线粒体基因组中的非编码区域的一部分,具有控制和调节的功能。本文采用LA—PCR和生物信息学的方法,研究了大蹼铃蟾的线粒体基因组D-loop区序列,其D-loop区具有三个保守序列（CSB-1,CSB-2 and CSB-3）,在5、和3、端还有独特的串联重复序列。通过分析总结其串联重复序列的特征和规律,有助于研究蛙科动物线粒体基因组进化机制。  相似文献   

线粒体DNA标记技术及其在蛛形学研究中的应用     

罗育发 《赣南师范学院学报》2005,26(6):58-60

综述线粒体DNA(mtDNA)的特征、线粒体基因组遗传特性认识的改进和mtDNA分子标记技术在蛛形学研究中的应用;并探讨了线粒体DNA标记技术在蜘蛛分子系统学研究和基因组分析中的广泛应用前景.  相似文献   

基因组重排的反转排序的近似算法     

李玉  李德荣  何莉敏  张勇 《洛阳师范学院学报》2010,29(2):8-10

本文主要研究基因无方向的基因组重排的反转排序问题.本文算法基于断点图的概念,给出一个时间复杂性为O(maxb3(π),nb(π)),空间复杂性为O(n)的求解近似最优解的算法,其中n为基因组中基因个数,π=(π1,π2,...πn)表示n个基因的一种排列,b(π)表示排列π中的断点数.数据试验的结果表明,该近似算法可以求得较好的结果.  相似文献   

蜜蜂（Apis）线粒体DNA（mtDNA）研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

谢进金  孙亮先  黄周英 《泉州师范学院学报》2001,19(2):54-58

综述蜜蜂线粒体DNA(mtDNA）的结构及其多态性在进化、分类、群体遗传结构和非洲化蜜蜂研究上的应用，蜜蜂mtDNA是一个裸露的闭合双链环状分子，长度在16，300-17，000bp之间，其中AT含量约占85%,线粒体基因组含有13个编码蛋白质的基因，22个tRNA左因，2个编码rRNA亚基基因和两个非编码区域，部分基因有重叠现象，根据mtRNA限制位点的多态性，可推断出四个蜜蜂的系统分化图为:Florea(dorsata (cerena,mellifera）；而西方蜜蜂在进行过程中形成三大分支：西欧型（M）、东欧型（C）、非洲型（A）、mtDNA多态性也是研究蜜蜂群体遗传结构和非洲化形成、扩散机制的有力工具。  相似文献   

常熟昆承湖畔农田土壤动物与土壤酶活性季节特征研究     

苏永春  邱晓婷  杜娟  勾影波 《常熟理工学院学报》2018,(5)

2011年3月至2012年7月对江苏省常熟市昆承湖周边菜地土壤动物种群、数量及土壤酶活性进行了研究.共采集土壤动物样本718个,隶属于3门4纲15类群.不同季节的土壤动物捕获数量不同,群落组成也有所差别.春季弹尾目和蜱螨目为优势类群;夏季弹尾目和多足纲为优势类群;秋季弹尾目和蜱螨目、膜翅目、线虫纲为优势类群;冬季蜱螨目和弹尾目为优势类群.全年合计优势类群为弹尾目和蜱螨目.同时测定土壤酶活性,脲酶采用奈氏比色法,蛋白酶采用酪素比色法,脱氢酶采用TTC比色法,转化酶采用还原糖测定法,过氧化氢酶采用容量法,多酚氧化酶采用碘量滴定法.土壤酶活性具有明显的季节特征,过氧化氢酶活性夏季达到最高值;多酚氧化酶活性冬季达到最高值;转化酶活性秋季达到最高值;脲酶活性秋季达到最高值;脱氢酶活性夏季达到最高值;蛋白酶活性春季是全年的最高值.土壤动物与土壤酶活性季节变化的关系研究表明,脱氢酶和过氧化氢酶与土壤动物总数和蜱螨类的关系程度高;转化酶和脱氢酶与弹尾类关系程度最高.  相似文献   

细胞质DNA   总被引：1，自引：0，他引：1  

马捷琼  刘缠民 《生物学教学》2003,28(6):49-50

自从 2 0世纪 6 0年代在衣藻的叶绿体中发现有DNA ,在鸡胚肝细胞线粒体中也发现有DNA以后 ,又陆续从各种生物细胞的叶绿体、线粒体和质粒中分离出DNA ,并发现其具有遗传物质的功能 ,人们称其为细胞质DNA。1　细胞质DNA的形态除在某些低等真核生物中有少量线粒体DNA是线状外 ,其它线粒体DNA (mtDNA)和叶绿体DNA(ctDNA)均呈双链环状。细胞质DNA的大小随生物种类不同而不同。动物细胞线粒体基因组比较小 ,而酵母线粒体DNA约是动物DNA的 5倍长 ,植物线粒体DNA的大小又约是酵母线粒体DNA的 5倍长。与核DNA相比 ,线粒体DNA所…  相似文献   

动物线粒体基因组全序列测定的研究策略     

尚娜  周志军 《河池学院学报》2008,28(2):62-65

动物线粒体基因组全序列测定是近年来生物学研究中的一个热点。科学技术的发展,对动物线粒体基因组全序列测定的研究策略也产生了深远的影响。在此对几种在动物线粒体基因组全序列测定中常用的几种策略进行了综述,并对其优缺点进行了比较分析。  相似文献   

线粒体遗传病     

袁忠 《生物学教学》2005,30(12):71-72

除哺乳动物成熟红细胞外，线粒体普遍存在于有氧呼吸的真核细胞的细胞质中，它是细胞内的能量供应中心。线粒体内亦存在自身的遗传系统，是动物细胞核外唯一含DNA的细胞器。人类细胞的线粒体DNA是人类基因组的组成部分，被称为“第25号染色体”。线粒体基因涉及编码多种tRNA、rRNA及一些功能蛋白质，它们共同参与维持线粒体自身的功能。最近10多年来，线粒体遗传与遗传病的研究十分迅速，现已确认线粒体DNA上有100多种致病点突变和200多种缺失、插入与重排。  相似文献   

动物的受精     

于建荣  王群 《生物学教学》2001,26(8):2-4

除单细胞动物以外 ,动物个体由两部分细胞组成 :不同类型的体细胞及生殖细胞。两者都是从受精卵发育而成。受精是动物个体发育的开始 ,单倍体的雌、雄生殖细胞结合 ,各自的单倍体基因组相融合形成两倍体合子 ,从而完成受精过程。不同动物精子的形状、大小和内部结构各不相同 ,主要分为两大类 :有尾类精子和无尾类精子。哺乳动物的精子属于有尾类精子 ,主要由三部分组成 :头部、颈部和尾部。头部由细胞核和顶体构成 ,其形态因动物而异 ,精子的核主要由ＤＮＡ和核蛋白组成 ;核的前面为顶体 ,顶体是一外包有单位膜的囊状结构 ,位于头部质膜与核…  相似文献   

沙塘鳢线粒体基因组全序列的测定和分析     

《常熟理工学院学报》2016,(4)

为揭示沙塘鳢(Odontobutis)线粒体基因组特征,采用PCR扩增和测序的方法获得沙塘鳢(Odontobutis)线粒体基因组全序列.通过生物信息学软件(t RNAscan-SE、RNAfold)定位沙塘鳢线粒体基因组基因结构及预测t RNA和r RNA的二级结构.沙塘鳢线粒体基因组全长16 930 bp,结构组成和其他硬骨鱼基本一致,包括13个蛋白质编码基因,22个t RNA,2个r RNA和1个D-loop区.13个蛋白质编码基因中,除了CO1是以GTG作为起始密码子,ND6以TTA作为起始密码子以外,其余都以ATG起始.沙塘鳢线粒体基因的终止密码子有3种类型,分别为完全密码子TAA、不完全密码子TA和T.除了t RNASer(AGN)和t RNACys外,其余20个t RNA基因的二级结构都是典型的三叶草结构.识别了沙塘鳢终止序列区、中央保守区D、E、F和保守序列区CSB-1、CSB-2和CSB-3.比较沙塘鳢cytb基因序列与其他物种同源性发现,沙塘鳢与平头沙塘鳢的同源性最高(87.03%),河川沙塘鳢次之(83.57%),与人的同源性最低(70.64%).该研究结果可为深入探讨沙塘鳢属及塘鳢科鱼类的系统分类提供依据,更真实地反映了沙塘鳢的分类地位和进化关系.  相似文献   

MGB probe assay for rapid detection of mtDNA11778 mutation in the Chinese LHON patients by real-time PCR     

Wang JY  Gu YS  Wang J  Tong Y  Wang Y  Shao JB  Qi M 《Journal of Zhejiang University. Science. B》2008,9(8):610-615

Objective:Leber's hereditary optic neuropathY (LHON)is a maternally inherited degeneration of the optic nerve caused by point mutations of mitochondrial DNA(mtDNA).Many unsolved questions regarding the penetrance and pathophysiological mechanism of LHON demand efficient and reliable mutation testing.This study aims to develop a minor groove binder(MGB) probe assay for rapid detection of mtDNA11778 mutation and heteroplasmy in Chinese LHON patients by real-time polymerase chain reaction(PCR).Methods:Forty-eight patients suspected of having LHON and their maternal relatives underwent a molecular genetic evaluation,with 20 normal individuals as a control group at the same time.A real-time PCR involving two MGB probes was used to detect the mtDNA 11778 mutation and heteroplasmy.A linear standard curve was obtained by pUCmLHONG and pUCmLHONA clones.Results:All 48 LHON patients and their matemal relatives were positive for mtDNA 11778 mutation in our assay,27 heteroplasmic and 21 homoplasmic.Eighteen cases did not show an occurrence of the disease,while 9 developed the disease among the 27 heteroplasmic mutation cases.Eleven did not show an occurrence of the disease,while 10 cases developed the disease among 21 homoplasmic mutation cases.There was a significant difierence in the incidence between the heteroplasmic and the homoplasmic mutation types.The time needed for running a real-time PCR assay was only 80 min.Conclusion:This real-time PCR assay is a rapid,reliable method for mtDNA mutation detection as well as heteroplasmy quantification.Detecting this ratio is very important for predicting phenotypic expression of unaffected carriers.  相似文献   

基于RT-HPLC的古代mtDNA序列差异性分析     

张金  张虎勤  郭晓萍 《绵阳师范学院学报》2007,26(5):59-63,85

线粒体DNA具有突变速度快、重组率低、严格母系遗传、拷贝数多等特点,近年来成为分子考古研究中的一个热点。为了研究古墓群中的血亲关系,可以从古墓葬遗留骨骸、牙齿中提取和扩增mtDNA片断进行分析。通过设计2对部分重叠的引物,扩增线粒体16055-16218区域目标片段,进行反相高效液相色谱分析,确认四个样品对应片断在反相柱上的保留时间上存在差异,以此推断扩增片段在序列上可能存在差异。为利用mtDNA分析人类母系血缘关系奠定了基础。  相似文献   

线粒体DNA突变与疾病     

陈龙 《周口师范学院学报》1999,(2)

介绍了线粒体DNA的遗传学特性,试从分子水平上探讨mtDNA突变发生情况,阐明mtDNA的突变与线粒体病和衰老的关系,简要说明了人类mtDNA突变的类型和相应的线粒体病的特点.  相似文献   

DNA标记及其在鱼类中的应用     

肖明松  鲍方印  夏海武  崔峰 《安徽科技学院学报》2011,25(5):10-15

DNA分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种比较理想的遗传标记技术。本文简要介绍RFLP、RAPD、AFLP、SSR、SNP、EST、mtDNA等DNA分子标记的类型,基本原理和特点,以及分子标记技术在鱼类遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等方面的应用前景予以展望。  相似文献   

河北380名汉族人群血型基因频率     

辛春艳 《河北北方学院学报(医学版)》1992,(2)

本文接血型常规检验法检测了380名(男166人,女214人)河北籍汉族大学生的ABO血型。用X~2方法对男女及河北地区与兰州、湖北地区血型分布进行了统计学分析,并根据Hardyweiberg定律计算了IA、IB、i的基因频率,结果表明:河北地区汉族人群血型分布B>A>O>AB,男女间无显著差异;河北地区分别与兰州、湖北地区相比,河北地区与湖北地区在B型和O型血的分布存在极显著性差异(P<0.01);河北地区汉族人群IA、IB、i的基因频率分别为:0.2251,0.2722,0.5027.这些结果为河北地区群体遗传学的研究提供了参数。  相似文献   

五华三黄鸡线粒体DNA控制区全序列分析     

黄勋和  林雅媚  李威娜  姚琼凤  钟福生 《嘉应学院学报》2014,(2):58-61

采用PCR和直接测序的方法测定五华三黄鸡两个类群--丰华和太和类群的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)全序列,比较分析其序列特征并构建系统进化树.结果表明:五华三黄鸡2个类群线粒体DNA控制区全序列长度分别为1232 bp、1231 bp.与原鸡相比,五华三黄鸡的丰华类群和太和类群都发现14个变异位点,其中丰华类群的变异均是基因转换,而太和类群有13个转换和1个缺失,没有观测到颠换;A+T碱基含量分别占60.4%和60.3%,G+C碱基含量都约占39.6%.五华三黄鸡与其它19种禽类的D-loop基因序列同源性的分子进化树聚类结果表明五华三黄鸡类群与中国红原鸡亲缘关系最近.  相似文献   

线粒体假基因研究综述     

李艳  黎霞  陈艳 《绵阳师范学院学报》2012,31(5):68-75

线粒体基因（mtDNA）在系统学、系统地理学和物种鉴定等领域被广泛应用,线粒体假基因（nuclear mitochondrial pseudogenes,Numts）的存在会影响系统发生关系、生物多样性研究和种群遗传参数的推断,以及线粒体相关疾病的研究和诊断。该文对Numts的序列特征、分布规律、转入机制、联合扩增的降低措施以及应用前景进行综述,以期在mtDNA应用中降低Numts的影响和为Numts的研究应用提供参考。  相似文献   

Sequence-length variation of mtDNA HVS-I C-stretch in Chinese ethnic groups     

Feng Chen  Yong-hui Dang  Chun-xia Yan  Yan-ling Liu  Ya-jun Deng  David J. R. Fulton  Teng Chen 《Journal of Zhejiang University. Science. B》2009,10(10):711-720

The purpose of this study was to investigate mitochondrial DNA (mtDNA) hypervariable segment-I (HVS-I) C-stretch variations and explore the significance of these variations in forensic and population genetics studies. The C-stretch sequence variation was studied in 919 unrelated individuals from 8 Chinese ethnic groups using both direct and clone sequencing ap-proaches. Thirty eight C-stretch haplotypes were identified, and some novel and population specific haplotypes were also detected. The C-stretch genetic diversity (GD) values were relatively high, and probability (P) values were low. Additionally, C-stretch length heteroplasmy was observed in approximately 9% of individuals studied. There was a significant correlation (r=-0.961, P<0.01) between the expansion of the cytosine sequence length in the C-stretch of HVS-I and a reduction in the number of up-stream adenines. These results indicate that the C-stretch could be a useful genetic maker in forensic identification of Chinese populations. The results from the Fst and dA genetic distance matrix, neighbor-joining tree, and principal component map also suggest that C-stretch could be used as a reliable genetic marker in population genetics.  相似文献