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1.
电路理论研究方法已经非常成熟.由于电路理论中的分析方法和基因网络结构功能很相似,因此可以采用电路理论中的分析方法,利用基因表达谱中的数据噪音,建立基因调控布尔网络.对基因和蛋白质,利用表达谱数据中的噪音建立基因调控布尔网络给出实例. 相似文献
2.
为了对高维的基因表达数据进行有效的降维,本研究采用基于Fisher准则的思想对特征空间进行特征组合,从而得到新的特征空间。实验结果表明,在无法对数据再进行降维的原特征空间中,经过线性变换的方法得到的新特征空间可继续对其数据进行降维。通过这种方法,能将四川省医学科学院动物研究所所提供的抑郁症大鼠DNA的基因表达数据有效地从4353维降到1393维。 相似文献
3.
在前人研究基础上对传统"信噪比"公式进行修正,然后对带有能够确定出肿瘤类型信息的基因表达谱样本的2000个基因数据进行剔除冗余数据处理,通过模糊聚类分析法进行分类,并对分类效果进行检验,说明修正的"信噪比"在数据冗余处理效果比较好,可以找出一种被命名为"信息基因"的决定样本类别的一组基因"标签",希望修正的"信噪比"对癌症领域中肿瘤样本处理上有一定的帮助. 相似文献
4.
通过机器学习方法辅助分析生物信息学中的数据,使用微阵列测试技术所获得的基因表达数据能够将任何给定条件下的基因表达模式表现出来,有利于研究人员更加深入地对众多生物过程的本质进行了解和掌握。文章对基因功能分类方法和基因表达数据的肿瘤分类进行了分析。对于基因表达数据的基因功能分类,按照功能类的隶属关系,提出基于功能树的优势因子决策和基于功能树的置信度调整准则,按照这两种标准进行基因功能树的基因功能分类算法改进。对于基因表达数据的肿瘤分类,将传统SVM算法和kNN算法两者进行结合,形成一种新型的分类算法,主要适用于肿瘤的分类。 相似文献
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随着基因芯片技术的快速发展以及其在基因表达分析等过程中的应用，产生了大量的基因表达谱数据，如何处理和分析这些数据并从中提取出有价值的生物学信息成为一个极为重要的课题，基因分类是进行基因数据处理的常用方法。本文首先利用主成分分析法(PCA)把基因的多个属性转化为少数几个综合属性，将基因表达谱数据映射成一个带权图，并将图论的最小生成树理论引入基因分类分析方法，然后设计了基于最小生成树的基因分类算法，理论分析和仿真结果表明了该算法的可行性和有效性。 相似文献
6.
肿瘤基因治疗是用正常或野生型基因矫正或置换致病基因或引入有治疗价植的其它来源基因的一种治疗方法.基因治疗一般是引入修饰基因于病人体内而并非该基因的产物,即是一种疗法而非新产品.但是,通过体内直接途径可将外湖DNA象传统的药物一样注射到机体内,帮、故有人称这些外源的DNA的基因药物.肿瘤基因治疗研究中,通常采用基因转移和基因灭活方法.基因转移是指将外源性目的基因导入病变细胞或其他细胞,目的基因的表达产物修饰缺陷细胞,使其恢复功能或使原有的功能得到加强,故又称为基因修饰.肿瘤基因修饰治疗研究包括免疫基因治疗、增强抑癌基因表达、靶向化疗或提高机体化疗耐受性等内容.基因灭活是应用反义技术特异性封闭某些基因的表达.反义技术是指利用针对特异性DNA和RNA片段按碱基配对的原则人工合成小分子核苷酸序列(反义寡苷酸),与其目的DNA和RNA序列互补结合,以选择性抑制目的基因翻译或转灵过程的技术和方法.在肿瘤基因灭活治疗中,订要是利用反义寡核苷酸抑制或封闭某些癌基因的表达.基因转移疗法一般分为两类:一是体细胞系基因转移,主要用于防治遗传性及非遗传性疾病;二是胚胎基因转移,用于预防遗传性疾病.临床上,基因治疗是指体细胞基因治疗.基因治疗基本上分为三步:(1)基因导入:是指把基因或合有基因的载体导入机体;(2)基因传递:是指基因从导入部位进入靶细胞核;(3)基因表达:是指细胞中治疗性基因产物的形成. 相似文献
7.
基因调控网络数据分析方法研究 总被引：1，自引：0，他引：1
DNA微阵列技术获得了大量的基因表达数据，为基因调控网络的研究提供了技术支持，基因表达数据分析成为目前生物信息学研究的热点和重点。利用教学模型和人工智能技术，研究分析基因表达数据之间的关系，构建合适的基因调控网络模型来模拟生物系统的行为，从中发现生物学规律，进而认识生命现象的本质，成为了生物信息学研究的重要内容。本文介绍了基因调控网络构建中常用的基因表达数据分析方法以及最新的研究进展。 相似文献
8.
乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)的慢性感染,与慢性病毒性肝炎、肝硬化、肝细胞癌(HCC)的发病密切相关,其发病机理涉及到很多基因的共同参与.病毒基因的复制和表达受到肝细胞中蛋白质因子的调节,肝炎病毒基因编码的蛋白与肝细胞中的蛋白能够结合,肝炎病毒蛋白在肝细胞中的表达对于肝细胞的基因表达谱产生影响,也可能是病毒性肝炎、肝硬化、肝细胞癌发病机制的重要机制.酵母单杂交技术、酵母双杂交技术、基因芯片技术、抑制性消减杂交技术、噬菌体展示技术、蛋白质分离纯化与基因克隆化的反向遗传学技术等,在肝炎病毒基因调控、肝炎病毒蛋白结合蛋白的研究、肝炎病毒蛋白反式激活靶基因的研究中都有重要的应用,是促进慢性病毒性肝炎发病机理研究,探索病毒性肝炎新型治疗技术和治疗方法的有效途径. 相似文献
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研究目的:MicroRNAs(miRNAs或miRs)是一种内源性非编码RNA,通过与信使RNA(mRNA)的3'非编码区结合,引起mRNA的断裂或蛋白质翻译的阻断,进而对基因表达进行负性调控。miRNAs可影响细胞的分化、增殖和生存等过程,其表达失调有引起疾病甚至肿瘤的可能。miRNA表达失调已在多种人类肿瘤中出现,包括甲状腺肿瘤。本文对不同类型的甲状腺肿瘤中出现的miRNAs表达失调及miRNAs可能的下游靶基因进行综述,为甲状腺肿瘤的临床诊断及治疗提供依据。创新要点:已有大量关于滤泡细胞起源,尤其是乳头状甲状腺癌(PTC)中miRNAs表达失调的综述,但对C细胞起源的甲状腺髓样癌(MTC)中miRNAs表达失调的研究并未形成系统。同时,在此之前没有关于各型甲状腺肿瘤miRNAs表达与其靶基因的综述报道。在这篇综述中,我们还列入了对甲状腺肿瘤患者外周循环血液中miRNAs表达谱的最新研究以及单核苷酸多态性(SNP)对甲状腺肿瘤的影响。重要结论:总结了miRNAs在各型甲状腺肿瘤中的表达谱(见表1、3、4、6);描述了在各型甲状腺肿瘤中不同miRNAs潜在的靶基因及其在肿瘤发生、发展、浸润、转移等多方面的作用(见图1;表2、5)。 相似文献
10.
《常熟理工学院学报》2017,(4)
在语音信号处理领域,端点检测作为语音信号处理的初始化工作,有效合理的端点检测方法不仅可以减少数据的存储量和处理时间,而且可以排除无声段的噪声干扰,使语音的后续处理更加准确.本文为医疗语音信号处理提供一种医院噪声环境下医疗语音信号的端点检测方法.综合采用频域下的特征倒谱距离、能量谱、能量谱方差、统计学特征谱熵值4种特征作为控制条件判断语音的端点.通过设计软件验证了算法的有效性. 相似文献
11.
把主分量分析(PCA)方法和自组织特征映射网络(SOM)相结合,应用到基因数据聚类分析中。首先对基因数据集进行PCA分析,提取出少量的特征主分量,再对数据集进行降维。这些主分量基本上可以反映原数据集的综合信息,然后应用SOM网络对得到的特征分量进行聚类分析,把相似的基因划分到一个区域。实验结果表明,与单一地选用SOM网络进行聚类分析相比,该方法有较高的分类正确率及较为清晰的分类边界,是一种非常有效的聚类分析方法。 相似文献
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提出一种结合二维PCA和二维LDA的降维方法,并将方法应用于人脸识别研究.对传统的半监督模糊聚类算法进行改造,使之可以直接用于二维数据矩阵进行动态聚类,并据此设计了一种动态学习算法.实验结果表明,与其他降维方法和聚类算法比较,这种结合了二维LDA的半监督聚类模型具有更好的识别率. 相似文献
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《赣南师范学院学报》2020,(3):36-40
为改善表面肌电信号手势识别的抗噪性和分类识别率,提出了一种基于多重分形特征的表面肌电信号手势识别方法.该方法首先借助多重分形测度分析手段,研究了不同手势动作下表面肌电信号的多重分形特性,根据不同手势表面肌电信号的多重分形谱之间的差异,提出了多重分形特征的提取算法,并利用多重分形特征结合支持向量机进行了手势识别.实验研究表明,上臂肌肉的表面肌电信号具有显著的多重分形特性,最大、最小概率子集分形维数差等多重分形特征可以作为不同手势动作的分类识别的有效特征,所提出的方法具有良好的分类识别性能,是一种有效的分类识别方法. 相似文献
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黄利文 《通化师范学院学报》2013,(4):9-11
针对高维数据的判别问题,采用改进的主成分分析法进行降维,按85%的贡献率提取判别数据的主成分,然后以近邻原则建立距离判别准则,并以该准则对待判样品进行判别归类.实例表明,对于高维数据的判别问题,通过降维的方法,有助于提高判别模型的判别正确率. 相似文献
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基因表达分析如定量PCR、RNA印记等需要应用内参基因对目标基因表达量进行校正,以期获得真实可靠的结果,管家基因是常用的内参基因。热带兰金钗石斛中管家基因的研究至今尚无报道。该文对金钗石斛腋芽cDNA文库中的5个管家基因的序列和基因表达进行了分析和检测。其中,4个基因编码泛素蛋白,1个编码a-微管蛋白,分别命名为DnUBQ1、DnUBQ2、DnUBQ3、DnUBQ4及DnTUA1.DnUBQ1基因的密码使用频率表现出与金钗石斛普遍密码子不同的偏好性。在低温春化前后和春化过程中,5个基因的表达均无明显改变,表现为组成型表达。因此,5个基因均可在研究金钗石斛春化相关基因的表达时作为参照基因使用。 相似文献
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针对BP神经网络在辅助诊断建模过程中因输入特征的多维性而造成模型精度低、建模时间长等问题,提出基于遗传算法—BP神经网络的乳腺肿瘤计算机辅助诊断模型。首先提取乳腺肿瘤感兴趣区域的几何特征、形状特征、灰度特征、纹理特征、频率特征和边缘特征共79维;其次,用遗传算法（GA）对提取的特征进行约简,去掉一些冗余特征,选择最能体现肿瘤良恶性的特征组合17维;最后采用BP神经网络对17维特征进行乳腺肿瘤辅助诊断研究。实验结果表明,基于GA-BP的模型在乳腺肿瘤识别中取得了良好效果。 相似文献
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针对当前学生综合素质评价方法的不足,提出了基于特征加权模糊屉原型聚类的学生综合素质评价与检索方法．该方法的特点是用权值表示学生综合素质数据各维贡献率的不同,用特征加权模糊K-原型聚类方法对数值型、评价型并存的数据集合进行划分,通过学生归属某个类别,可获得学生综合素质的情况．在此基础上,给出了基于模糊K-原型聚类的学生综合素质检索方法,实验结果表明．该方法能提高学生综合素质检索的查准率和鲁棒性较强． 相似文献
18.
优化特征加权的FCM算法 总被引：1，自引：0，他引：1
冯春辉 《邢台职业技术学院学报》2009,26(1)
模糊聚类是一种重要数据分析和建模的无监督方法.在FCM算法中,考虑到样本矢量中各维特征对模式分类的不同影响,本文提出一种优化特征加权的模糊聚类算法,该算法利用主成分分析法提取主要特征向量并根据其对方差的贡献率不同赋予相应权重进行聚类分析. 相似文献
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《赣南师范学院学报》2019,(3):73-77
人WRAP53基因隶属于WD重复蛋白家族,被发现在端粒酶的组装、卡哈尔体的形成和DNA损伤的修复等过程中发挥着重要作用,但WRAP53基因表达调控的分子机制尚不明确.利用生物信息学软件对人WRAP53基因近端启动子-2 000 bp～-1 bp区域的结构特征、转录因子结合位点和CpG岛进行预测分析.Promotor 2.0和NNPP均预测出人WRAP53β基因有2个启动子;JASPAR和AliBaba 2.1发现有众多转录因子潜在结合位点存在该序列上;CpG Plot、CpG Finder和MethPrimer软件均预测出人WRAP53基因启动子-2 000 bp～-1 bp区域存在1个CpG岛.对人WRAP53基因启动子区开展的生物信息学分析,有助于了解该基因启动子区的结构和功能,为后续开展人WRAP53基因表达调控机制研究奠定了基础. 相似文献
20.
《赣南师范学院学报》2022,(3):31-35
由于人的心脏是一个复杂的非线性混沌系统,利用多重分形分析手段来研究心电(electrocardiosignal,简称ECG)的混沌也是一种趋势.文章利用质量指数、多重分形谱两个概念,定性地分析了心电信号具有多重分形特性.并利用质量指数对称度、多重分形谱宽度、最大最小概率子集分形维数差、多重分形谱非对称指数作为心跳周期的多重分形特征,结合支持向量机(Support Vector Machine,简称SVM)在3个心电数据库进行仿真测试.测试得到的心跳判别结果通过多数投票规则以判断受测者的身份,身份识别率达到96.67%,是一种可行的识别方法. 相似文献