共查询到17条相似文献，搜索用时 218 毫秒
1.
根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学的方法,以大豆液泡膜H^＋-ATPaseA亚基基因cDNA序列为信息探针,通过电子克隆得到了蒺藜苜蓿液泡膜H^＋-ATPaseA亚基cDNA,命名为MtVHA-A。该cDNA长2750bp,其中含5’非翻译区220bp,开放阅读框1875bp,3’非翻译区655bp,其推断的编码产物由624个氨基酸组成,理论分子量为69kDa,与蜜柑、番茄、拟南芥、棉花等植物中液泡膜H^＋-ATPaseA亚基氨基酸序列同源性高达90％以上,且有很高的功能区段保守性。 相似文献
2.
从菊芋（Helianthus tuberosus L.）块茎cDNA文库中获得了一个新的植物类金属硫蛋白基因 htMT2的cDNA序列,全长509bp,包括240bp的开放阅读框、62bp的5’端非翻译区、207bp的3’端非翻译区.通过 相似文献
3.
以牛的ANGPTL1基因为研究对象,利用生物信息学方法,对牛的ANGPTL1基因进行了电子克隆和序列分析,并对推导出的ANGPTL1蛋白结构与性质进行了初步分析。结果表明,牛的ANGPTL1基因序列长为2576 bp,该基因的编码序列长为1 476 bp,编码492个氨基酸,编码序列的两翼有135 bp的5’非编码区和785 bp的3’非编码区。DNA序列的G+C百分含量为44.31%,A+T百分含量为55.69%。该基因的核苷酸序列与人、黑猩猩、鼠和狗ANGPTL1基因的cDNA序列的相似性分别为91%、90%、82%和93%。在氨基酸序列上与人、黑猩猩、鼠和狗的相似性分别为95%、95%、92%和95%。用氨基酸序列构建的进化树显示,在人、牛、黑猩猩、狗、褐鼠、原鸡几种动物中,牛与狗的亲缘关系最近。 相似文献
4.
生命现象遗传信息的流向都遵循分子生物学中的“中心法则” ,即从DNA到RNA再到蛋白质。由于绝大多数真核生物基因和某些原核生物基因是断裂基因 ,即在基因的DNA序列中插有一些无编码意义的片段 ,编码序列称为外显子 ,非编码序列称为内含子。由于基因中内含子的存在 ,基因在表达时 ,遗传信息在mRNA水平有一个剪接过程 ,即去掉内含子 ,将外显子连接起来 ,最终产生一个有功能的成熟mRNA分子。1990年 ,Hirata等在酵母液泡膜H+-ATPase的a亚基 (VMA1)中首次发现了蛋白质自剪接现象。蛋白质自剪接是前体蛋白中间的某些区域被切除 ,剩余部… 相似文献
5.
6.
7.
300 mmol/L NaCl明显抑制大麦幼苗的生长，NaCl处理的同时加入20 m妙L的GSH可明显增加大麦幼苗干重、根系长度、叶
片叶绿素以及K+含量，降低Na+含量；同时叶片液泡膜H+-ATPase和H+-PPase的活性均明显增加，电解质渗漏率降低. 相似文献
8.
李裕红 《泉州师范学院学报》2012,30(6):36-42
根据已克隆得到的泉州湾可口革囊星虫MnSOD基因片段（GenBank登录号为EF 062359）,采用5’RACE和3’RACE技术从泉州湾可口革囊星虫体壁中克隆获得MnSOD的cDNA全长序列.该基因全长988bp（GenBank登录号为JX117903）,其中开放阅读框（ORF）长681bp,编码226个氨基酸,是不具跨膜区结构的亲水性稳定蛋白;预测分子量为25.15ku,理论等电点pI为5.96,分子式为C1 128H1 722N314O330S6;α螺旋是其蛋白质二级结构的主要元件,在氨基酸多肽链上有4个Mn结合位点,有3个二硫键位点.四聚体三维结构模型预测结果显示该MnSOD含12个α螺旋和3个β折叠构成一个篮子状的活性中心.泉州湾可口革囊星虫MnSOD基因与其他动物的胞质MnSOD在序列组成、结构及活性位点等方面存在高度相似性. 相似文献
9.
茶树β-1,3-葡聚糖酶基因cDNA片段的克隆与序列分析 总被引：2，自引：0，他引：2
文章首次从茶树中克隆出-β1,3-葡聚糖酶基因cDNA1369bp连续序列。根据已发表的植物中β-1,3-葡聚糖酶基因的保守序列,设计一对简并引物,采用RT-PCR技术,从茶树中扩增出366bp的cDNA片段。根据此片段序列设计特异引物,利用3'RACE获得-β1,3-葡聚糖酶cDNA 3'端1252bp的cDNA片段。序列分析表明:该基因cDNA 3'端核苷酸序列及其推测的氨基酸序列与其他植物的-β1,3-葡聚糖酶基因家族的cDNA相应序列同源性为50%-90%,经序列拼接,本研究从茶树中克隆出-β1,3-葡聚糖酶基因cDNA3'端1369bp的连续序列,GenBank登录号为AF399920。 相似文献
10.
5’LongSAGE标签得自于全长mRNA分子的5’末端的前19 nt.该研究利用定位在西方蜜蜂基因组中的一个预测基因座LOC724521的2条5’LongSAGE标签序列作为5’引物,通过RT-PCR克隆了该预测基因座的2条长335 bp和337 bp的cDNA序列（GenBank登录号：GU358205,GU358204）.此cDNA编码一条长88个氨基酸残基的多肽.用所克隆的cDNA序列对基因座LOC724521进行功能注释发现,该基因含有3个外显子和2个＂GT-AG＂型内含子.5’LongSAGE标签序列的基因组定位结果显示：基因座LOC724521在雄蜂的头部中表达丰度很高,RNA PolⅡ可从5个转录起始位点（TSS）上以不同效率起始转录,该基因的59%和31%的转录是从2个优势TSS上起始.有趣的是,有一条5’LongSAGE标签序列被定位在内含子区,暗示该基因存在外显子的可变性选择现象.该研究结果不仅在转录水平上证实了软件预测的基因座LOC724521确实存在,同时揭示了该基因存在可变性转录起始位点和可变性外显子选择等转录调控机制. 相似文献
11.
肌动蛋白（actin）在维持细胞结构、细胞运动和细胞分裂等过程中发挥着重要的作用.为了克隆鳡（Elopichthys bambusa）β-肌动蛋白（β-actin）全长cDNA,采用反转录PCR（RT-PCR）和cDNA末端快速扩增（rapid amplification of cDNA ends,RACE）技术,从鳡肌肉获得全长为1775bp的β-actin cDNA序列,其中包含1128bp的开放性阅读框,编码375个氨基酸,5′-非翻译（UTR）区为98个核苷酸,3′-UTR区为549个核苷酸.核苷酸与氨基酸的同源性分析发现,鳡β-actin与鲤形目类硬骨鱼的同源性均在98%以上,其中与团头鲂（Megalobrama amblycephala）的同源性最高,分别为98.94%和99.73%,而与其他脊椎类动物如哺乳类、鸟类、两栖类的同源性也分别在85%和97%以上,说明该基因在生物的分子进化过程中具有很高的保守性.采用核苷酸系统发育分析结果显示鳡β-actin与鲤形目类硬骨鱼聚类在一起,且与团头鲂的亲缘关系最近.RT-PCR分析结果显示,β-actin基因在鳡的肝脏、肾、肠、脑、心脏、鳃和肌肉等7个组织均有表达. 相似文献
12.
利用西方蜜蜂雄蜂头部5’LongSAGE文库中的一组标签序列,在蜜蜂基因组序列第9号连锁群上定位一个新的西方蜜蜂表皮蛋白基因转录起始位点,并克隆了该基因的eDNA序列,继而利用此cDNA序列分析了该基因的内含子和外显子结构．分析结果显示：该基因的DNA序列长1253bp,含有4个外显子和3个内含子,其cDNA长598bp,编码一个169AA的富含Val和Pro残基（23．67％,20．12％）多肽序列．BLAST分析发现,该蛋白与已知的4个昆虫表皮蛋白序列的相似性为47．54％,且其C末端有一个共有基序,说明这5个蛋白可能属于同一个表皮蛋白家族．该研究结果提供了一个新的蜜蜂表皮蛋白基因,且该基因在雄蜂头部表达水平较高． 相似文献
13.
构建马氏珠母贝腹足SMART cDNA质粒文库,测序和在GenBank中进行同源性查找,得到了核糖体40s亚基S13基因的全长cDNA序列。马氏珠母贝S13的cDNA全长554bp,推测的开放阅读框位于27-479,编码151个氨基酸,其中亮氨酸16个,所占比例为10.6%。马氏珠母贝S13同鲶鱼以及真菌纲的球毛壳的同源氨基酸序列相似性分别为90.05%和72.85%,很保守,可以用于种以上生物的进化关系研究。聚类分析显示,马氏珠母贝与脊椎动物和昆虫的亲缘关系较近,同线虫、水稻、啤酒酵母和球毛壳等动植物、真菌等相距较远。 相似文献
14.
生肌决定因子 MyoD 是生肌调节因子 MRFs 家族的一个重要成员,在基因转录调控中起着重要的作用.本实验通过 RT-PCR 和3’-RACE 等方法,以松江鲈肌肉总 RNA 为模板,扩增出957 bp 的 MyoD 基因部分序列,包含部分编码区长567 bp,编码翻译188个氨基酸残基,3’-UTR 区长390 bp.系统发育分析表明,松江鲈 MyoD 与奥尼罗非鱼亲缘关系最近.不同组织半定量分析显示,松江鲈 MyoD 在各种组织中均有表达,在心脏中表达量最高,预示着在不同组织中该基因的功能广泛 相似文献
15.
Using degenerate primers and RT-PCR,RACE techniques,a 1491 bp cDNA segment of stearoyl-acyl carrier protein desaturase(SAD)is cloned from developing seeds of Jatropha curcas L.The segment contains a 1191 bp of complete open reading frame(ORF).Analysis in the BLAST on NCB! shows that Jatropha curcas SAD(JSAD)gene encodes a protein precursor composed of a signal peptide of 33 amino acids and a mature peptide of 363 amino acids.The homological analysis shows that JSAD has high level of homology both in nucleotide sequence and in amino acid sequence to other plants SADs.The nucleotide and peptide identity of JSAD to Ricinus communis SAD(RSAD)is up to 89% and 96.2% respectively.Molecular modeling of JSAD indicates that its three-dimensional structure strongly resembled the crystal structure of RSAD. 相似文献
16.
新城疫病毒(NDV)ND-xx08毒株经10 d龄SPF鸡胚增殖后,提取其基因组RNA并反转录成cDNA,用NDV F基因特异性引物,经PCR扩增后获得与F基因预期大小一致的DNA片段。将NDV F基因片段克隆到pMD18-T载体上,并进行EcoR I和Hind III双酶切鉴定和测序鉴定。结果显示,ND-xx08毒株F基因片段的长度为1 662 bp,共编码554个氨基酸,F蛋白的裂解位点为112R-R-Q-K-R-F117,是典型强毒株氨基酸序列结构。将NDV ND-xx08株F基因的47 bp到420 bp序列与新城疫病毒基因型I至基因型Ⅸ毒株的相同序列绘制病毒基因进化树,显示ND-xx08分离株属于基因Ⅶe型。将NDV ND-xx08株F全基因与国内外发表的23株NDV F基因核苷酸序列和氨基酸序列的同源性比较分析,结果表明,其核苷酸序列的同源性在82.7%~97.8%之间,氨基酸同源性在87.5%~97.7%之间。 相似文献
17.
以新牧1号苜蓿为研究材料,采用RT-PCR方法,设计特异引物,从新牧1号苜蓿中克隆获得MvDREB基因cDNA,测序结果该片段全长为651 bp,Genbank登录号为GU073286.生物信息学分析结果表明,该基因序列与紫花苜蓿核苷酸序列相似度达99%,编码216个氨基酸,MvDREB蛋白氨基酸序列分析比对显示该蛋白属于AP2/ERF家族的亲水性核蛋白,蛋白质分子量为24873.1,理论等电点pI为5.90,不稳定参数为45.07. 相似文献