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相似文献
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1.
BLAST序列比对与生物医学文献检索   总被引:4,自引:1,他引:4  
生物信息学的急速发展及其数据库的急剧增长给文献检索提出了新课题。利用生物信息相关数据库需要结合生物信息学知识。本研究从新基因的名词与序列入手,介绍NCBI的ENTREz、BLAST检索,阐明与基因相关的文献检索的方法与技巧,着重介绍了BLAST序列比对在信息检索中的步骤和作用。  相似文献   

2.
钱宗华  周建军 《内江科技》2007,28(4):19-19,22
模式识别在生物信息学研究中占有很重要的地位生物的奥秘都隐藏在基因或者蛋白质序列里,而序列信息的规律可通过引入的模式识别方法来找到.本文介绍了几种在当今生物信息学领域应用得最广泛.取得识别效果最好的模式识别方法.  相似文献   

3.
本文综合分析了生物信息学这一现代新兴学科的定义和内涵,介绍了近年来国内外对于现代生物信息学的认识、重要的数据库和分析软件及其主要研究领域;并结合农业生物技术发展综合阐述生物信息学在其发展前景。  相似文献   

4.
随着计算机网络技术的发展,生命科学以及信息科学两个领域之间的关联更加密切,这促进了生物信息学的良好发展,并在一定程度上使得现代医药产业和生物工程都得到了进一步的发展。当前我国在生物信息学中的研究进展较为可观,其中在生命科学中研究所得的核酸与蛋白质两大分子的结构序列,极大地丰富了生物信息学数据库结构和种类。但是在生物信息学在实际应用中,仍然有很大的发展空间,需要与各类科学技术进行结合,以完善我们当前所获取和存储的生命序列信息,并以此促进我们的农业、生物工程、动物遗传育种等方面的应用发展。本文详细研究了当前生物信息学在动物遗传育种中的应用策略,推进动物遗传育种研究的进一步发展。  相似文献   

5.
随着生物信息学的快速发展,序列比对算法成为研究的热点问题。本文介绍序列比对算法的概念及研究,并针对几种常用的序列比对算法进行比较。同时也简单说明序列比对算法的改进方向。  相似文献   

6.
《大众科技》2010,(5):1-1
在以往的研究中,针对短测序片段进行的比较基因组分析,多数都需要有事先组装好的DNA序列作为参照,这在一定程度上制约了这类数据在生物信息学研究方面的发展。近期,中国科学院西双版纳热带植物园生态进化组教授Cannon带领其组员发明了一种新的研究方法,即不用事先组装,通过分析检测数据中是否存在达到某种“复杂度”的基因片段和出现频次,  相似文献   

7.
在分析生物信息学领域已有数据库、整合平台的基础上,归结了目前生物学数据库融合的两种模式:交叉引用模式和集成模式,并总结了目前系统的不足及数据库融合面临的困难,为进一步研究序列库与文献库的整合打下基础.  相似文献   

8.
生物物种的多样性的价值越来越被人们所认识与利用。生物多样性的原因是生物进化的过程中,物种和物种之间、物种和无机环境之间共同进化形成的结果。对生物进行系统发育分析可以发现它们之间的亲缘关系及进化过程,使我们对其的利用更具针对性。重建生物类群的系统发育树已经成为生物信息学中一个十分重要的研究内容,并日益受到广泛的关注。本文综述了系统发育分析的各种研究方法以及生物信息学在其中的应用,并对生物信息学中所采用的研究生物进化关系的方法进行了比较,分析了其在生物信息学的发展趋势。  相似文献   

9.
生物信息学技术与新基因研究的有效落实,既能够凭借因子序列条件有效确定当前生物信息体系构建中所具备的协调优势,从而确保当前社会医疗功能体系构建具备先进性,同时更能够凭借相关数据库统筹和克隆技术延伸,为后续生物信息学的有效构建和发展,提供扎实且可持续化的拓展意义。本文基于生物信息学技术与新基因的特性展开分析,在确定基因序列与调节数据之间的关系同时,期望能够为后续生物信息学的有效构建,提供扎实且全面的数据统筹参照。  相似文献   

10.
蛋白序列进化图谱分析软件采用跨平台的java语言开发,基本功能包括蛋白序列的转换与显示;蛋白进化图谱的绘制;蛋白分型与汇总;变异位点统计;蛋白质糖基化统计;蛋白序列相似性矩阵统计。软件可以解决生物信息学、分子系统学领域复杂的蛋白序列的绘制和数据处理工作。  相似文献   

11.
目的本研究主要是了解菊叶香藜psbA基因的分子结构,以及为菊叶香藜的分类学提供分子数据。方法文章通过生物信息学分析软件,对菊叶香藜psbA基因全序列进行分析,预测出氨基酸序列、统计序列组分、编码蛋白理化性质、亲疏水性、跨膜区域、二级结构、三级结构、密码子偏好性等。结果菊叶香藜psbA基因编码序列长度为1059bp,GC含量为41%,共编码353个氨基酸,最多的为丙氨酸(A),为35个(9.9%),不含有赖氨酸,符合psbA基因的特征。二级结构包含α-螺旋(57.51%),β-折叠(4.82%),β-转角(37.68%)。psbA基因编码蛋白为疏水性蛋白,包含7个跨膜区域,是非酶类转运蛋白。psbA基因密码子偏好性水平相对较弱,主要受到选择作用、表达水平和蛋白质长度的影响。psbA系统发生树结果显示,菊叶香藜未与藜属其它植物归为一类。结论因此,根据菊叶香藜生物信息学特征和系统发生树结果,支持将菊叶香藜归到刺藜属中。  相似文献   

12.
试析异构生物信息数据库的整合   总被引:1,自引:0,他引:1  
朱海燕 《现代情报》2006,26(3):50-52
本文阐述了生物信息数据库对生物信息学研究的重要性,介绍了世界上主要生物信息学数据的类型和特点,同时指出了在生物信息学研究与发展中,对异构生物数据库整合的必要性和迫切性。描述了三种已研究开发的异构生物信息数据库整合平台。  相似文献   

13.
随着生物学的发展,涌现了大量的生物信息数据,而我们如何有效地分析它们蕴含的信息,发现他们之间的联系和不同,是学者们乃至全人类需要思考的问题,虽然科学家们已经开发了很多方法,但仍然不能获得最准确的结果。针对这种情况,本文综合了国内外发展现状,又运用了生物信息学方面的知识介绍了SDTW算法在生物信息学中的应用—DNA序列相似性的比对。本文首先介绍了SDTW算法的原理和流程,然后又对它应用于DNA序列相似性比对的步骤进行了概述,并通过数据分析了算法的可行性,最后进行了总结。  相似文献   

14.
生物信息学是现代生物学、计算机科学和数学的交叉学科,主要通过数学方法借助计算机对生物数据进行科学分析,相对于传统实验方法更高效、更具有逻辑性。本文主要以Linux系统的衍生系统——Ubuntu系统为分析系统,介绍如何配置最适合于生物信息学分析的计算机环境。  相似文献   

15.
生物信息学:我们能做什么?   总被引:1,自引:1,他引:1  
本文重点介绍了国内外生物信息学的研究现状,分析了情报学与生物信息学的联系,并提出了情报学在生物信息学研究中的切入点。  相似文献   

16.
生物信息学是对生物科学所产生的大量数据进行分析和管理的学科。数据挖掘技术在生物信息学领域具有良好的研究与应用前景。对在生物信息学中的数据挖掘技术的应用进行了研究。  相似文献   

17.
科学工作流是数字化科研的强有力工具,其基本构成部分是Web服务.在生物信息学应用领域,Web服务一般通过本体进行语义描述,并封装成语义Web服务.文章以描述逻辑及其SHIQ语言为基础,研究目的在于定义生物信息学领域的Web服务语义描述框架,主要方法包括服务的语法与语义定义,语义Web服务的查询与匹配以及多服务的组合机制.最后以DNA序列查询以及格式转换为例,论述了具体的应用方式,实际使用有较好的效果.研究结论是:语义封装以及语义查询可以很好解决无状态Web服务查询匹配的精确度问题.  相似文献   

18.
尖吻蝮蛇是我国十大剧毒蛇之一,其毒液主要作用于血液系统引起出血、肿胀与局部组织坏死。当前,生物信息学高速发展,使全世界的生物学研究数据和成果得到共享。本文主要从尖吻蝮蛇蛇毒中的出血毒素的生物信息学上进行分析论述。  相似文献   

19.
《科技风》2020,(3)
生物信息学是以生物学、数学及计算机科学为基础而发展形成的一门学科,该门学科以核酸与蛋白质作为主要的研究对象,研究手段以计算机科学及数学为主,进而对生物学的实验数据进行有效的获取、储存与分析,进而达到对数据内所涵盖的生物学进行揭示的目的。我国生物信息学的快速发展,也为生命学科研究提供了有效的基础。随着我国生物研究不断的深入与计算机技术的快速发展,当前生物信息学已经在多个领域发挥出了重要作用。基于此,本文对生物信息技术在微生物研究中的应用进行了分析。  相似文献   

20.
蛋白质结构类型是蛋白质高级结构中基本原件的空间分布,是蛋白质高级结构与功能研究的基础,该研究对蛋白质组学具有重要意义。通过传统实验方法研究蛋白质结构类需要耗费大量的人力、财力、物力,也无法满足数据库中蛋白质序列爆炸性增长的现实需要。目前,基于已积累数据,探索理论计算方法预测蛋白质结构类是当前生物信息学的重要研究内容之一。本文对国内外亚细胞定位预测的研究现状进行了综述。  相似文献   

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