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BLAST序列比对与生物医学文献检索 总被引:4,自引:1,他引:4
生物信息学的急速发展及其数据库的急剧增长给文献检索提出了新课题。利用生物信息相关数据库需要结合生物信息学知识。本研究从新基因的名词与序列入手,介绍NCBI的ENTREz、BLAST检索,阐明与基因相关的文献检索的方法与技巧,着重介绍了BLAST序列比对在信息检索中的步骤和作用。 相似文献
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模式识别在生物信息学研究中占有很重要的地位生物的奥秘都隐藏在基因或者蛋白质序列里,而序列信息的规律可通过引入的模式识别方法来找到.本文介绍了几种在当今生物信息学领域应用得最广泛.取得识别效果最好的模式识别方法. 相似文献
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本文综合分析了生物信息学这一现代新兴学科的定义和内涵,介绍了近年来国内外对于现代生物信息学的认识、重要的数据库和分析软件及其主要研究领域;并结合农业生物技术发展综合阐述生物信息学在其发展前景。 相似文献
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《黑龙江科技信息》2020,(9)
随着计算机网络技术的发展,生命科学以及信息科学两个领域之间的关联更加密切,这促进了生物信息学的良好发展,并在一定程度上使得现代医药产业和生物工程都得到了进一步的发展。当前我国在生物信息学中的研究进展较为可观,其中在生命科学中研究所得的核酸与蛋白质两大分子的结构序列,极大地丰富了生物信息学数据库结构和种类。但是在生物信息学在实际应用中,仍然有很大的发展空间,需要与各类科学技术进行结合,以完善我们当前所获取和存储的生命序列信息,并以此促进我们的农业、生物工程、动物遗传育种等方面的应用发展。本文详细研究了当前生物信息学在动物遗传育种中的应用策略,推进动物遗传育种研究的进一步发展。 相似文献
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生物物种的多样性的价值越来越被人们所认识与利用。生物多样性的原因是生物进化的过程中,物种和物种之间、物种和无机环境之间共同进化形成的结果。对生物进行系统发育分析可以发现它们之间的亲缘关系及进化过程,使我们对其的利用更具针对性。重建生物类群的系统发育树已经成为生物信息学中一个十分重要的研究内容,并日益受到广泛的关注。本文综述了系统发育分析的各种研究方法以及生物信息学在其中的应用,并对生物信息学中所采用的研究生物进化关系的方法进行了比较,分析了其在生物信息学的发展趋势。 相似文献
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目的本研究主要是了解菊叶香藜psbA基因的分子结构,以及为菊叶香藜的分类学提供分子数据。方法文章通过生物信息学分析软件,对菊叶香藜psbA基因全序列进行分析,预测出氨基酸序列、统计序列组分、编码蛋白理化性质、亲疏水性、跨膜区域、二级结构、三级结构、密码子偏好性等。结果菊叶香藜psbA基因编码序列长度为1059bp,GC含量为41%,共编码353个氨基酸,最多的为丙氨酸(A),为35个(9.9%),不含有赖氨酸,符合psbA基因的特征。二级结构包含α-螺旋(57.51%),β-折叠(4.82%),β-转角(37.68%)。psbA基因编码蛋白为疏水性蛋白,包含7个跨膜区域,是非酶类转运蛋白。psbA基因密码子偏好性水平相对较弱,主要受到选择作用、表达水平和蛋白质长度的影响。psbA系统发生树结果显示,菊叶香藜未与藜属其它植物归为一类。结论因此,根据菊叶香藜生物信息学特征和系统发生树结果,支持将菊叶香藜归到刺藜属中。 相似文献
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试析异构生物信息数据库的整合 总被引:1,自引:0,他引:1
本文阐述了生物信息数据库对生物信息学研究的重要性,介绍了世界上主要生物信息学数据的类型和特点,同时指出了在生物信息学研究与发展中,对异构生物数据库整合的必要性和迫切性。描述了三种已研究开发的异构生物信息数据库整合平台。 相似文献
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生物信息学是现代生物学、计算机科学和数学的交叉学科,主要通过数学方法借助计算机对生物数据进行科学分析,相对于传统实验方法更高效、更具有逻辑性。本文主要以Linux系统的衍生系统——Ubuntu系统为分析系统,介绍如何配置最适合于生物信息学分析的计算机环境。 相似文献
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生物信息学是对生物科学所产生的大量数据进行分析和管理的学科。数据挖掘技术在生物信息学领域具有良好的研究与应用前景。对在生物信息学中的数据挖掘技术的应用进行了研究。 相似文献
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科学工作流是数字化科研的强有力工具,其基本构成部分是Web服务.在生物信息学应用领域,Web服务一般通过本体进行语义描述,并封装成语义Web服务.文章以描述逻辑及其SHIQ语言为基础,研究目的在于定义生物信息学领域的Web服务语义描述框架,主要方法包括服务的语法与语义定义,语义Web服务的查询与匹配以及多服务的组合机制.最后以DNA序列查询以及格式转换为例,论述了具体的应用方式,实际使用有较好的效果.研究结论是:语义封装以及语义查询可以很好解决无状态Web服务查询匹配的精确度问题. 相似文献
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