固有无序蛋白质-DNA复合物结合位点处核苷酸偏好性分析     

郭珍珍  朱玉风  王吉华 《德州学院学报》2013,29(2):50-53

固有无序蛋白质是一种新的蛋白质类型,具有显著的序列结构特征,尤其在与DNA相互作用中发挥着重要功能.分别统计分析了固有无序蛋白质有序区和无序区与DNA形成的复合物中,位于结合位点处脱氧核苷酸的结合偏好性以及与氨基酸组成结合对的偏好性.结果发现,参与这种相互作用的脱氧核苷酸类型具有显著差异,其中鸟嘌呤脱氧核苷酸和胸腺嘧啶脱氧核苷酸较受欢迎,而腺嘌呤脱氧核苷酸和胞嘧啶脱氧核苷酸不受欢迎.我们还发现四种脱氧核苷酸都偏好与精氨酸和赖氨酸组成结合对,而很少与天冬氨酸和谷氨酸结合.因此,本文将为今后DNA与其它分子相互作用研究提供可靠的数据和方法支持.  相似文献   

固有无序蛋白质(IDPs)的预测和分子动力学模拟研究     

朱玉风  陈艳如  曹赞霞  王吉华 《德州学院学报》2014,(6):6-13

固有无序蛋白质是一类在生理状态下没有固定三维结构,却可以发挥正常生物学功能的蛋白质.对这类蛋白质系统深入的研究丰富了人们对蛋白质生物学功能的认识.固有无序蛋白质预测经过十多年发展,已经成为发现新固有无序蛋白质的重要工具;而分子动力学模拟则为我们从微观上研究固有无序蛋白构象变化过程、分析固有无序蛋白与其他分子的相互作用,以及揭示这类蛋白质的特征等发挥了不可替代的作用.  相似文献