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1.
LilrB2蛋白与Aβ(1-42)寡聚态的结合会造成阿尔茨海默症的某些症状,研究其中的结合方式对设计针对性抑制剂具有重要意义。以lilrB2蛋白和Aβ(16-21)双分子链为研究对象,通过分子对接设定3个不同构象作为分子动力学模拟起点,分析3组体系的模拟轨迹,发现lilrB2蛋白上的ASP23残基与Aβ(16-21)单支链上的LYS残基有较强的相互作用,对受体和配体结合起到了重要的影响。在不同结合状态下,lilrB2蛋白的CYS142和SER24残基与Aβ(16-21)支链上VAL、PHE和ALA残基的疏水作用也有利于lilrB2蛋白和Aβ(16-21)双分子链的结合。 相似文献
2.
3.
陈建超 《周口师范学院学报》2011,28(2):48-51
受限于碳纳米管中的冰或水是进行纳米尺度生物通道研究的重要模型,对一定条件下其内部结构的研究将为碳纳米管的实际应用提供可能.采用分子动力学模拟分别对温度为240K,压强为500MPa,550MPa和600MPa下受限于(14,0)zigzag型碳纳米管中的水分子进行了研究,得到了不同压强值下水分子在碳管中的密度分布等静态性质.结果表明:随着压强值的增大管内水分子的结构会发生相变,即由正四方形水分子链生成正五边形水分子链;在压强增大导致发生相变过程中,水分子由无序变得有序. 相似文献
4.
王凤圣 《中国科学院大学学报》2017,34(1):55-63
骨形态发生蛋白2(BMP-2)在人体组织和器官的再生过程中起着重要的作用.利用分子动力学模拟(MD)的方法探究BMP-2在带正电荷和负电荷的自组装单层膜(SAMs)上的吸附情况.SAMs是由分子CH3-(CH2)9-X组成,其末端官能团选择为SO3-和N(CH3)3+.模拟结果显示,尽管BMP-2带8个负电荷,在带负电和正电的表面都能被吸附.更有趣的是,发现蛋白的吸附强度还取决于BMP-2表面带电氨基酸的分布情况.此外,BMP-2吸附在正电荷表面后活性位点朝向表面,吸附在负电荷表面后活性位点朝向溶液. 相似文献
5.
辛东嵘 《福建工程学院学报》2015,(1):28-30
采用分子动力学方法,计算交联度92%的环氧树脂的力学性能参数,并比较不同温度下,环氧树脂力学性能参数的改变。研究结果表明,分子动力学模拟结果与试验结果相吻合。模拟结果显示,随着温度升高,交联环氧树脂的弹性模量、剪切模量和体积模量等性能下降,温度高于玻璃温度之后,环氧树脂力学性能下降显著。 相似文献
6.
正追溯起来,"量子药物化学"的提法早在20世纪80年代国内就出现过,然而很快就消声匿迹了。这是由于量子化学计算往往需要非常昂贵的模拟时间,而受限于当时计算机的计算能力,应用量子化学计算进行大体系、大规模的药物筛选等药物化学问题的研究,几乎被认为是不可能的事情。然而,伴随着这十年来超级计算机的迅猛发展, 相似文献
7.
8.
2004年5月,美国金属学会(ASMInternational)决定将该年度的材料科学研究银质奖章(Materials Science Research Silver Medal)授予美国约翰霍普金斯大学(Johns 相似文献
9.
10.
通过分子动力学模拟,研究DNA/B-PDEAEA纳米颗粒的自组装过程。模拟结果表明,在自组装过程中静电相互作用是主要驱动力;在相同氮磷比的条件下,随着DNA碱基对数目的增加,更易于形成稳定的纳米颗粒。在相同碱基对数目的条件下,随着氮磷比的增加,更趋向于形成稳定的纳米颗粒。 相似文献