人类新基因HBVDNAPTP1结合蛋白的生物信息学分析     

伦永志  刘为国  朱莹  张国元  毛小强  司红敏  王琳 《大连大学学报》2006,27(6):80-83

[目的]应用生物信息学分析人类新基因乙型肝炎病毒(HBV)DNA聚合酶(Polym erase)反式调节蛋白(HBVDNAPTP1)结合蛋白(HBVDNAPTP1BP).[方法]利用生物信息学技术分析HBVDNAPTP1BP基因的染色体定位与组织表达,以及编码蛋白的化学物理性质与结构特征.[结果]HBVDNAPTP1BP基因染色体定位于1号染色体短臂3区5带1亚带,可在组织中低表达,但在多个组织中无表达.HBVD-NAPTP1BP的相对分子量为11 905.6,理论pI为7.72,不同条件下的消光系数为14 230 M-1cm-1或13 980M-1cm-1(280 nm),在体外哺乳动物网状细胞中的半寿期为30 h,并且无卷曲螺旋区域,但具有3个较强的疏水区域.HBVDNAPTP1BP无特殊二级结构,仅有1个蛋白激酶C磷酸化位点,不具有跨膜螺旋结构,无信号肽序列,定位于细胞核中.[结论]应用生物信息学对HBVDNAPTP1BP进行了分析,为进一步研究其生物学功能及其在乙型肝炎、肝细胞癌中的作用机制提供了依据和线索.  相似文献   

菌物生物多样性与人类可持续发展   总被引：2，自引：0，他引：2       下载免费PDF全文

魏江春 《中国科学院院刊》2010,25(6):645-650

文章对菌物生物多样性从下列三个角度进行了论述。首先,在自然界生物圈中的生物多样性包括物种、基因和生态系统三个层次;而物种多样性则是最基础和关键的。菌物是自然界物种多样性最丰富的两大类生物之一。其次,菌物分类学是研究菌物物种多样性的重要工具。第三,生物信息、菌种以及菌物原型参证的三个存取系统,作为菌物分类学的研究成果,是人类可持续发展所需要的可再生的生物资源的重要支撑系统。最后,为了加强对菌物物种多样性和基因多样性的研究、保护和开发,作者提出了4点建议。  相似文献   

生物序列比对算法研究现状与展望   总被引：6，自引：0，他引：6  

张敏 《大连大学学报》2004,25(4):75-78,82

序列比对是生物信息学研究的一个基本方法,寻求更快更灵敏的序列比对算法一直是生物信息学研究的热点.本文给出了生物序列比对问题的定义,综述了目前常用的各类比对算法,并对每一类算法的优缺点以及应用范围进行了分析,最后指出序列比对算法目前存在的问题以及未来的发展方向.  相似文献   

集群式计算机系统在生物信息学中的应用     

周澄  郁松年 《上海大学学报(英文版)》2003,7(4):370-374

1　Introduction　SMP (symmetricmulti processing)andMPP (mas sivelyparallelprocessing)arethetwotypesofstruc tureofparallelcomputing .　Symmetricmulti processingsystemshavemultipleCPUsattachedtothesamebusandsharingRAM .Massivelyparallelprocessingisthecooperated pro cessingofaprogrambymultipleprocessorsthatworkondifferentpartsoftheprogram ,witheachprocessorusingitsownoperatingsystemandmemory .ThechoicebetweenSMPandMPPdependsonthenatureoftheproblembeingsolved .Iftheproblemcanbeeasilypartit…  相似文献   

GenBank数据库检索及其应用——Entrez检索功能     

李轶 《中华医学图书馆杂志》2008,(5):49-51

GenBank数据库是世界上著名的生物信息数据库,包含了目前所有已知的核苷酸序列和蛋白质序列以及与它们相关的文献著作和生物学注释。详细介绍了它的Entrez检索功能。  相似文献   

群智能优化算法及其在生物信息学问题中的应用     

宁静  钟一文  林娟  宁正元 《三明高等专科学校学报》2013,(4):13-18

生物信息学研究需要使用先进的计算工具处理大量生物的模糊的和不确定的数据。群智能优化算法以低成本、快速和准确合理地解决复杂的搜索问题的优点,使其成为一族能用以较好地解决生物信息学中的问题的启发式算法。综述群智能优化算法及其在生物信息学问题中的应用。  相似文献   

生物信息学序列库与文献库的整合模式浅析     

杨文  韩涛  孙志茹 《情报理论与实践》2008,31(1):112-115

在分析生物信息学领域已有数据库、整合平台的基础上,归结了目前生物学数据库融合的两种模式:交叉引用模式和集成模式,并总结了目前系统的不足及数据库融合面临的困难,为进一步研究序列库与文献库的整合打下基础.  相似文献   

运筹学课程在生物信息学专业中的教学探索     

李彭平  胡杰  吕飒丽  汪强虎 《教育教学论坛》2020,(16):250-251

生物信息学是现代生命科学发展过程中,生物医学与数理科学、计算机技术相结合而形成的新兴前沿交叉学科。运筹学在生物信息学中有着广泛应用,可为学生后续专业课学习和应用研究提供指导。文章结合生物信息学专业特点,对于如何提高运筹学在生物信息学专业中的教学质量和培养具有创新能力的生物信息学人才,探讨了运筹学在生物信息学专业教学中的教学目的、教学内容以及教学方法和手段。  相似文献   

生物信息学课程研究性教学的实践与思考   总被引：1，自引：0，他引：1  

张纪阳  刘伟  谢红卫 《高等教育研究学报》2011,34(4):51-53,57

作为新兴交叉学科,生物信息学处于蓬勃发展阶段,来自不同学科的理论和观点不断融合,技术和方法迅速更新,这些特点决定了在课程建设和教学中,非常适合实施开放式的研究性教学。但与此同时,这也为课程的建设和施教带来了挑战和困难。结合《生物信息学》课程的教学实践,从确定课程的目标与定位、选择和组织教学内容、设计和实施研究性教学、准备和推荐扩展阅读材料等方面,探索了这一类课程建设与施教的特点和方法。  相似文献   

生命科学信息时代的标志--生物信息学   总被引：1，自引：0，他引：1  

郭晓华  王欣强 《沈阳教育学院学报》2005,7(3):131-133

生物信息学是自1990年启动人类基因组计划之后应运而生的具有生物信息时代标志的交叉学科。它所涉及的范围包括生物研究信息的采集、处理、存储、分发、分析、注释等各个方面。本文仅就生物信息学中的基因组信息学、蛋白质组信息学、生物进化和药物设计等生物信息学的重点研究内容进行概述。  相似文献