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[目的]新的大肠癌相关性抗原EID3的基因克隆及其诊断价值研究.[方法]利用大肠癌病人体内血清中所含的对肿瘤抗原产生的特异性抗体筛选睾丸组织cDNA噬菌体表达文库和大肠癌组织cDNA噬菌体表达文库(SEREX),并用RT-PCR技术研究EID3 mRNA在正常组织和大肠癌传代细胞表达.[结果]睾丸组织cDNA噬菌体表达文库筛选得到了可以诱导大肠癌病人抗体免疫应答的新抗原EID3基因(Gen-bank NM_001008394.1).它们定位于染色体19q13.2,EID3含1个外显子.通过RT-PCR分析发现,EID3基因在43例大肠癌传代细胞株中,39例阳性,阳性率为90.7%.在正常组织中,除睾丸组织外不表达或有极低水平转录.[结论]EID3 mRNA表达检测用于诊断大肠癌,可能具有高特异性和高敏感性的特点.EID3蛋白被首次发现在大肠癌病人中能够诱导机体的抗体免疫应答,为一个新的大肠癌相关性抗原分子.其功能可能与抑制细胞的恶性增殖相关,并可进一步研究其用于治疗和诊断大肠癌的可行性. 相似文献
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耐辐射异常球菌(D.radiodurans R1)osmC基因(DR_1538)编码的渗透诱导胁迫蛋白是一种在氧化胁迫中起重要作用的过氧化物酶.用PCR方法从耐辐射异常球菌中扩增出osmC基因的全长序列(441bp),采用原核表达系统对其进行表达纯化,获得了分子量大小约为18.7 kDa的带有His标签的融合蛋白.利用在线网站对OsmC蛋白的生物信息学分析,结果表明:OsmC蛋白由146个氨基酸组成,理论等电点为5.81,为亲水性蛋白;二级结构主要是由α-螺旋及不规则卷曲组成.OsmC蛋白的纯化及生物信息学分析为后续深入研究其功能奠定了基础. 相似文献
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目的:从大麦全基因组中鉴定AS2/LOB基因家族,并进行基因进化、基因结构、染色体定位以及组织、表达分析,为大麦ASL/LBD基因进一步功能研究与鉴定奠定基础。创新点:首次在大麦全基因组水平上分析AS2/LOB基因家族,并对部分基因的功能进行预测和分析。方法:利用大麦基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定大麦AS2/LOB基因家族成员;采用MEGA6软件进行系统进化树分析;利用GSDS及Map Draw工具进行基因结构及染色体定位分析;利用已有的大麦RNAseq数据进行组织表达谱分析。结论:通过全基因组分析,大麦AS2/LOB家族基因包括24个成员,在进化上分为两大类,7个亚家族,分布于大麦7条染色体上,组织表达模式具有多样性,与已经报道的ASL/LBD基因具有良好的同源性。这些信息为大麦AS2/LOB基因家族的功能分析奠定了基础。 相似文献
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《赣南师范学院学报》2020,(6):87-93
生物体内的铁蛋白Ferritin在储存和释放铁离子、抗氧化胁迫和病菌侵染过程中发挥着重要作用.为探索玉带凤蝶(Papilio polytes)铁蛋白的功能,本研究开展了对玉带凤蝶铁蛋白亚基的鉴定,分析其组织表达谱和铁离子胁迫下的表达水平.基于玉带凤蝶基因组数据库,鉴定了铁蛋白轻链亚基(PpFerLCH)和重链亚基(PpFerHCH)基因并且克隆出2个基因的开放阅读框(ORF);利用生物信息学,对其结构域以及与其他物种的进化关系进行分析;采用实时荧光定量PCR技术分析两个亚基在不同组织以及铁离子胁迫下的表达水平.玉带凤蝶PpFerLCH基因cDNA全长为1207 bp,其开放阅读框为696 bp,编码231个氨基酸,预测其蛋白分子量为26.5 kDa,理论等电点为5.64;PpFerHCH基因cDNA全长为1 300 bp,ORF为636 bp,编码211个氨基酸,预测其蛋白分子量为23.7 kDa,理论等电点为6.53.结构域分析显示PpFerLCH和PpFerHCH都含有一个保守的铁蛋白结构域,而PpFerHCH具有Ferrihydrite nucleation center.系统发育树分析揭示PpFerLCH主要与烟草天蛾(Manduca sexta)以及大蜡螟(Galleria mellonella)铁蛋白重链亚基保持较高的同源性,而PpFerHCH与烟草天蛾具有较近的亲缘关系.实时荧光定量PCR分析表明PpFerLCH和PpFerHCH在玉带凤蝶的中肠和马氏管中表达量较高,而在其他组织表达量相对较低.此外,FeCl_3刺激24以后,PpFerLCH和PpFerHCH能够被显著诱导上调表达.本研究为进一步研究玉带凤蝶铁蛋白的功能奠定基础. 相似文献
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目前,要确切知道人类染色体组基因数目,还有相当大的困难.据推测,人基因总数将是10万左右而非过去估计的5万左右.其中,大部分可能在基因组内富含基因的区域簇集.明显的例子是主要组织相容性区域:在仅长为4000Kb的DNA上有78个以上的基因,它们之中有些排列得很紧密,以致相互重叠.现发现,基因内还有包含基因的现象,即“嵌埋基因”,如在凝血第Ⅷ因子基因F8中包含有另一基因;在神经纤维瘤病1基因NFI的第1内含子中有3个基因:OMG、EVI2A和EVI2B.1973年6月,人类基因定位第1次国际工作会议(HGM1)时,已定位25个人基因,其中还包括已被证明是错误的2个基因.1991年8月,HGM11汇集了已定位人基因数(不含脆性位点和未知功能的DNA片段,但含假基因以及一些与已知基因高度同源的所谓“类”序列) 相似文献
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目的:揭示水稻低植酸基因OsLpa1的分子生物学特征,特别是深化对其可变剪切和表达的时空和组织特征,以及蛋白亚细胞定位的认识。创新点:确定了OsLpa1存在的三种剪切方式,明确了三种转录本在不同组织和发育时期丰度的变化;揭示了OsLpa1表达的组织和时空差异,确定其在根、种子糊粉层细胞和花丝中高度表达;明确了三种转录本编码的蛋白均定位于亚叶绿体。方法:通过培育OsLpa1启动子与β-葡萄糖醛酸糖苷酶(GUS)杂合基因的转基因植株,通过不同组织的GUS组织化学染色确定OsLpa1表达的组织特异性;通过设计特异性引物确定OsLpa1存在的转录方式,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)分析三种转录本在不同组织和发育时期的丰度;采用OsLpa1三种转录本与绿色荧光蛋白(GFP)基因构建杂合基因并在水稻原生质体中的瞬时表达,在共聚焦显微镜下观察蛋白的亚细胞定位。结论:OsLpa1在根、茎、叶和花丝有强烈的表达。它存在三种可变剪切方式,产生的三种转录本存在明显的时空和组织差异,但其编码的蛋白均定位于叶绿体。 相似文献
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从美利奴羊衍生出来的Booroola绵羊携带增加排卵数和产羔数的一个常染色体突变主效基因(Fec^B)。该位点已被定位到绵羊6号染色体的一个区间内。通过对可能候选基因的分析排除了包括6号染色体在内的与繁殖控制有关的大量基因(主要包括糖蛋白激素α亚基基因、促卵泡素β亚基基因、促黄体素β亚基基因、促卵泡素受体基因、促黄体素受体基因、促性腺激素释放激素受体基因、仪抑制素基因、α抑制素基因、βA抑制素基因、促卵泡素抑制蛋白基因、类胰岛素生长因子Ⅰ基因等)。 相似文献
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Ya WANG Meng-yun XU Jian-ping LIU Mu-gui WANG Hai-qing YIN Ju-min TU 《Journal of Zhejiang University. Science. B》2014,(7)
研究目的:通过研究水稻泛素缀合酶基因OsUbc13的序列特征、表达模式、亚细胞定位模式及其互作分子,为深入研究该基因的生物学功能和分子作用机理奠定基础。创新要点:首次对植物Ubc13进行了亚细胞定位研究及蛋白互作研究。研究方法:通过序列比对及聚类分析进行OsUbc13的序列特征研究;通过实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)进行OsUbc13的表达模式分析;通过聚乙二醇(PEG)介导转化烟草BY-2原生质体进行OsUbc13亚细胞定位研究(见图4);通过酵母双杂交进行OsUbc13的蛋白质互作分析(见图5和表1)。重要结论:OsUbc13编码具有153个氨基酸的蛋白质,其推断的氨基酸序列与其它同源序列具有很高的相似性;该基因在水稻各组织中均有表达,其中内稃、雌蕊、雄蕊和叶片中的表达量较高,而根、茎和外稃中的表达量较低;低温、甲基磺酸甲酯(MMS)和过氧化氢(H2O2)胁迫处理使胚性愈伤中OsUbc13的表达量显著上调,甘露醇、脱落酸(ABA)和氯化钠(NaCl)胁迫则使愈伤组织中该基因的表达量降低;OsUbc13与绿色荧光蛋白(GFP)的融合蛋白表达于质膜和核膜处;酵母双杂交结果表明约有20个蛋白可能与OsUbc13存在相互作用,其中OsVDAC(与细胞凋亡有关)、OsMADS1(与花器官发育有关)、OsB22EL8(与活性氧清除及DNA保护有关)和OsCROC-1(为Lys63聚合泛素链形成及运行无误性DNA损伤耐受机制所必需)四个蛋白经验证确与OsUbc13互作。 相似文献
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鹅MYL1基因的克隆及胚胎期表达特征分析 总被引：1，自引：0，他引：1
肌球蛋白是肌纤维的主要组成成分,在肌肉生长和收缩过程中具有重要作用.本研究以鹅（Anser anser）肌肉总RNA为模板,采用RACE的方法,克隆肌球蛋白轻链1（MYL1）基因全长cDNA序列,并进行生物信息学分析.运用实时荧光定量PCR检测MYL1基因在鹅胚胎期的表达特征.结果表明,鹅MYL1基因全长cDNA为1542 bp,编码193个氨基酸残基的肽链.预测鹅MYL1蛋白等电点5.12,分子量21.75 KD,具有典型的EFh和FRQ1结构域,且不同物种间EFh氨基酸序列高度同源.荧光定量PCR结果显示鹅胚胎期MYL1基因mRNA表达量总体呈现上升后下降的趋势,该基因在胚胎期E7就有表达,E7以后表达量逐渐上升,在E18表达量达到高峰后下降.研究结果首次提供了鹅肌肉组织主要结构基因MYL1的全序列和蛋白特征信息,并揭示该基因在鹅肌肉组织发生和发育的功能. 相似文献
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[目的]探讨腹膜、腹膜后间质瘤的临床病理特点.[方法]对大连大学附属医院近3a收治11例腹膜、腹膜后间质瘤患者的临床病理特点及用免疫组织化学方法检测CD117、CD34、SMA、S100蛋白表达的情况进行回顾性分析.[结果]11例患者中发生于结肠(横结肠)上区3例,结肠(横结肠)下区8例.肿瘤未能完整切除者4例.肿瘤大小≤2cm者2例,>2～5cm者1例,>5～10cm者3例,>10cm者5例.细胞形态以梭形细胞为主9例,以上皮样细胞为主2例.11例患者CD117全部阳性,CD34阳性7例,SMA阳性5例,S100全阴性.[结论]结果提示腹膜、腹膜后间质瘤作为GIST的一种特殊类型,有着其自身的临床病理特点. 相似文献
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[目的]通过对H IV-1在母婴传播的个体间病毒基因亚型和准种的差异性研究揭示H IV-1在母婴传播过程中的变异规律.[方法]提取H IV-1感染母亲及其子女共4例的血浆中总RNA,通过逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)获得H IV-1 env基因的C2-V5区域片段,纯化后连接至T载体,转化至Top10大肠埃希菌内增殖,通过蓝白筛选获得阳性克隆,阳性克隆为模板行PCR,产物进行构象敏感性凝胶电泳(CSGE)分析,挑选优势准种和劣势准种测序.[结果]第一对母亲准种复杂性较其子女低,母子之间各准种的核苷酸序列高度同源,均为C亚型;第二对母亲准种复杂性较其子女高,母子之间各准种的核苷酸序列高度同源,母子均为AE亚型.[结论]H IV-1在母婴传播过程中亚型不发生变化,病毒准种在传播过程中可能具有选择性,进入新宿主后因环境变化而被重新筛选,二者可能共同导致优势/劣势准种的变化.此外,母婴之间准种的复杂性与其宿主的免疫状态有关. 相似文献
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川芎嗪对人乳腺癌MCF-7/ADM细胞多药耐药性的逆转及P-糖蛋白表达的影响 总被引：2，自引：0，他引：2
[目的]探讨川芎嗪(TMP)对人乳腺癌MCF-7/ADM细胞的耐药逆转及其对该细胞P-糖蛋白(P-gp)表达的影响.[方法]MTT法测定细胞的药敏性和抗药性逆转,流式细胞术检测耐药细胞P-糖蛋白的表达.[结果]非细胞毒性剂量(320μg/m l)和低毒剂量(1 250μg/m l)的川芎嗪均能显著降低MCF-7/ADM细胞的IC50(P<0.01),逆转倍数分别为2.14和2.80倍;并使该细胞P-gp的表达率由(90.60±0.40)%分别降低至(69.10±1.65)%和(60.30±1.25)%.[结论]川芎嗪可部分逆转人乳腺癌MCF-7/ADM细胞对阿霉素的耐药性,其逆转机制与抑制该细胞P-gp的表达有关. 相似文献
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[目的]观察复方甘草甜素(美能)对慢性乙型肝炎的治疗作用.[方法]将病人随机分为为两组,治疗组10例,用美能40 m l/d.iv.3周后改为口服美能片75 mg,每日3次.对照组1 0例,使用甘利欣150 mg/d,VD.3周后改为口服甘利欣100 mg,每日3次.[结果]治疗组治疗后症状缓解率75%;血清ALT水平由306.70±229.33 u/L降为105.00±86.11 u/L;血清AST水平由137.90±71.44 u/L降为64.30±34.93 u/L;血清SB水平由31.80±28.90 umol/L降为16.20±3.43 umol/L.对照组治疗后症状缓解率为66.7%;血清ALT水平由208.20±160.13 u/L降为77.20±65.92 u/L;血清AST水平由92.60±61.19 u/L降为51.20±31.38 u/L;血清SB水平由20.60±5.08 umol/L降为11.70±2.06 umol/L.[结论]复方甘草甜素(美能)的临床疗效与国内同类产品(甘利欣)相仿,具有较好的保肝、降酶作用,有一定的优势. 相似文献
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[目的]了解甘草酸苷对慢性乙肝患者血糖的影响.[方法]把95例确诊为慢性乙型肝炎的患者随机分为A、B、C三组,分别给予复方甘草酸苷80 m l、复方甘草酸单铵120 m l、甘草酸二铵40 m l静脉点滴,用药前、用药2周及4周观察三组患者的空腹血糖、肝功能、HBVM、HBV-DNA定量.[结果]治疗前三组患者空腹血糖的均数分别为5.28±1.75、5.32±1.66及5.65±1.82 mmol/L,在用药2周时,三组患者空腹血糖的均数即已有所下降,至用药4周其空腹血糖的均数分别为4.5 1±1.6 5、4.6 8±1.3 7及4.9 8±1.87 mmol/L,与治疗前相比三组患者空腹血糖的均数都有不同程度下降,但治疗前后的差异无显著性(P>0.05),各组之间下降的差异亦无显著性(P>0.05).[结论]甘草酸苷对慢性乙肝患者的血糖没有升高作用,反而在一定剂量下有降低的作用. 相似文献
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文章利用一系列的生物信息学软件分析了盐芥ATPase E Like基因编码蛋白的氨基酸组成、等电点、结构域、特征位点、二级结构等蛋白质性质,并同拟南芥ATPase E1、E2、E3蛋白作了对比.结果表明:盐芥ATPase E Like基因编码蛋白分子式为:C1132H1867N325O349S9,属于不稳定蛋白;二级结构主要是以α螺旋为主.在所分析的指标中,盐芥ATPase E Like蛋白与拟南芥ATPase E1、E2、E3相比存在着一定差异. 相似文献