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发现编码序列和非编码序列中有明显的尺度联系的存在性会给弄清DNA序列带来新的前景,这就促使我们去寻找新的方法来描述和区分编码和非编码序列。在这篇文章中,首先采用数值序列来表示DNA序列,然后以多重仿射性分析和Holder指数形式来得到三个指数,并以此构建参数空间。每个编码或非编码序列就被表示为这个三维参数空间之中的一个点。在这个参数空间中,完全基因组中的编码序列和非编码序列被粗略地分开到两个不同的区域。 相似文献
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解廷月 《雁北师范学院学报》2007,(6)
以果蝇染色体的全序列和基因间序列作为研究对象.分别用描述序列构成的两个信息参数X和F分析两类序列沿着染色体分布特征,并着重讨论染色体着丝粒及其周围区域的分布规律,用线性拟合和多项式拟合分析染色体各类序列沿染色体的统计分布特征(学生t检验),分析各个参数的平均值在染色体不同区域的分布. 相似文献
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DNA分类方法的探讨 总被引：3，自引：0，他引：3
ＤＮＡ序列分类的方法有很多种．本文给出了两种模型都是在图象的基础上，利用图象的直观、易于分析等优点，找到各种碱基不同的特征，得出一个比较合理的方法． 在建立模型时，先计算出给定的前２０种ＤＮＡ序列中各碱基Ａ，Ｇ、Ｃ、Ｔ的含量 （将一串长序列简化成了四个百分含量数值，大大简化了序列），并以此含量为数据作出直角坐标系下的二维曲线．根据曲线的特征，得出了两个算法，一个是以其中的一个ＤＮＡ序列中碱基的含量大于其它三种含量为特征分出类别，对２１至４０种序列的分类正确率达到 ８０％，对于题中所给的 １８２种序列分类正确率为 ４２％；另一个是通过转化曲线为直线的方法找出符合分类特征的区间，根据是否在此区间内而分出类别，对２１至４０种序列的分类正确率达到１００％，对于题中所给的１８２种序列分类正确率为８５％． 最后，通过对比两种模型的结果，判断出两种模型的优劣，并分析了其中的原因． 相似文献
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Using the complete genome of Plasmodiumfalciparum 3D7 which has 14 chromosomes as an example, we have examined the distribution functions for the amount of C or G and A or T consecutively and non-overlapping blocks of m bases in this system. The function P(S) about the number of the consecutive C-G or A-T content cluster conforms to the relation P(S)oce-as;values of the scaling exponent αCG are much larger than αAT; and αAT of 14 chromosomes are hardly changed, whereas αCG of 14chromosomes have a number of fluctuations. We found maximum value of A-T cluster size is much larger than C-G, which implies the existence of large A-T cluster. Our study of the width function ξ(m) of cluster C-G content showed that follows good power law ξ(m)ocm-γ. The average γ for 14 chromosomes is 0.931. These investigations provide some insight into the nucleotide clusters of DNA sequences, and help us understand other properties of DNA sequences. 相似文献
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BEREZHNOY Andrey Yu SHCKORBATOV Yuriy G. HISANORI Kiryu 《Journal of Zhejiang University. Science. B》2006,7(12)
INTRODUCTION It is well known that the physical properties, namely DNA strands interaction in promoter are connected with their activity. As it was established the two promoter regions ?35 and ?10 are the most important for the promoter functioning, all bases in the ?35 (TTGACA) and ?10 (TATAAT) hexamers were highly conserved (Harley and Reynolds, 1987; Hawley and McClure, 1983). The functional impor- tance of these sequences was proved in many inves- tigations (Record et al., 199… 相似文献
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The energy of interaction between complementary nucleotides in promoter sequences of E. coli was calculated and visualized. The graphic method for presentation of energy properties of promoter sequences was elaborated on. Data obtained indicated that energy distribution through the length of promoter sequence results in picture with minima at -35, -8 and ＋7 regions corresponding to areas with elevated AT （adenine-thymine） content. The most important difference from the random sequences area is related to -8. Four promoter groups and their energy properties were revealed. The promoters with minimal and maximal energy of interaction between complementary nucleotides have low strengths, the strongest promoters correspond to promoter clusters characterized by intermediate energy values. 相似文献
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植物基因组的研究已经由以全基因组测序为目标的结构基因组学转向以基因功能鉴定为目标的功能基因组学研究.植物功能基因组学研究是利用结构基因组学积累的数据,从中得到有价值的信息,阐述DNA序列的功能,从而对所有基因如何行使其职能并控制各种生命现象的问题作出回答.近年来植物功能基因组学的研究技术主要包括表达序列标签、基因表达的系列分析、DNA微阵列和反向遗传学等.对植物功能基因组学的研究将有利于我们对基因功能的理解和对植物形状的定性改造和利用. 相似文献
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解廷月 《雁北师范学院学报》2006,22(5):46-50
由于真核生物基因组染色体上各种序列的组织和安排复杂,所以我们把果蝇染色体上顺次排列的DNA序列分成内含子和编码序列两类.分别用描述序列构成的四个信息参数,分析各类序列沿着染色体分布特征,并着重讨论染色体着丝粒及其周围区域的分布规律,并解释引起这些特征的原因.用线性拟合和多项式拟合分析染色体各类序列沿染色体的统计分布特征(学生t检验),分析各个参数的平均值在染色体不同区域的差别.果蝇染色体参数X值是由D1(碱基偏置)和D2(碱基关联)值共同决定的,但果蝇染色体的编码序列参数X分内含子序列相比,分布没有趋同性.显示出编码序列跟内含子序列染色体的分布不同. 相似文献
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延安精神是中共中央在延安时期领导各界群众进行民主革命实践过程中形成的优良作风和革命精神,传承延安精神的核心在于对延安精神本质的把握。延安精神在当代存在着四大困境,必须坚持以人为本的原则,对原有的延安精神内容体系进行时代性的继承和创新。 相似文献
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不同的多视点视频序列具有不同的时空相关性,MVC采用的分层B帧预测结构无法充分利用视频序列的属性。本文提出了一种能适应不同视频序列编码的方法,通过研究多视点视频图像中的时空相关性和视点间的相关性,适当地取消部分时间层的视点间预测并且对所有P视点的非关键帧均采用视点间预测和调整了I视点的位置。实验结果表明,本文方法在提高编码效率的同时使得预测结构具有更好的随机访问性能、更低的编码复杂度。 相似文献
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新型DNA聚合酶——Pfu酶的研究 总被引：1，自引：0，他引：1
介绍了PCR技术的发展历程,阐述了DNA聚合酶对于PCR技术发展的重要性。比较了各种DNA聚合酶如Taq、Vent、Pwo和Pfu酶的性能,从而显示新型DNA聚合酶-Pfu酶的性能优势,并指出完善Pfu酶仍需努力的方向。 相似文献
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洛特曼的诗歌文本分析理论是其结构诗学的重要组成部分。在洛特曼看来,诗歌文本是一个复杂的符号系统,这主要体现在诗歌文本结构的不同要素、不同层次之间的相互联系上,这是诗歌文本建构的关键所在。茨维塔耶娃是一位极具个性的诗人,认为自己是“纯抒情诗人”,诗歌是其情感表达的重要载体。从洛特曼结构诗学的角度,研究茨维塔耶娃的诗歌,可以分析出诗人笔下同一符号所传达出的不同感情色彩,能够更深入地把握其诗歌文本的建构,了解其中的自传性特征。 相似文献
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DNA芯片技术是近年发展起来的DNA分析技术，它采用高速打印或光刻合成技术可在硅片、玻璃或尼龙膜上制造DNA微阵列.样品DNA通过PCR扩增、体外转录等技术掺入荧光标记分子，与微阵列杂交后，通过荧光扫描仪扫描及计算机分析即可获得样品中大量基因序列及表达信息.该技术可应用于DNA序列测定、基因表达水平检测、基因及多态性检测、发现新基因等多个研究领域. 相似文献
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方铖 《襄樊职业技术学院学报》2008,7(1):9-11
自1994年Adleman发表了第一篇关于DNA分子计算的文章以来,DNA计算迅速成为活跃的研究领域。利用DNA计算解决了图的最小顶点覆盖问题,在构造了合有6个顶点10条边的图的顶点集对应的数据池之后,进行了一系列的合成、杂交、清洗、变性等生物操作。得到所有覆盖对应的DNA序列,然后通过编址得到所要求的最小覆盖。 相似文献
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二叉树的构造有多种方法,给出一棵二叉树的中序序列和后序序列,可以构造出这棵二又树,但一般采用递归算法.尽管递归算法具有结构简炼、清晰、可读性强等优点,但递归算法在执行过程会耗费太多的时间和空间,为了追求算法的时空效率,必须将递归算法转化为非递化算法,问题才能得到有效解决,本文设计了一个非递归算法,输入一棵二又树的中序遍历和后序遍历的结点序列,构造出该二又树,该算法对于一棵有n个结点的二又树,具有O(n)时间复杂度,是解决该问题的最优算法. 相似文献
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茅盾《蚀》中的“时代女性”一直是人们津津乐道的女性形象,她们身上有多重可被“打开”的理解空间。在以前被一锅煮的“恋爱”中耙梳出三重意义的恋爱,找寻出相应的时代女性的行为、心理状态以及其后的时代思潮和作者的思想状态等,发现茅盾最终还是消解了苦心经营的“三重恋爱”,这一消解背后隐藏着作者的巨大痛苦、复杂的历史革命语境以及一些被遮蔽的东西。 相似文献
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采用三种不同的方法(质粒酶切、16S rRNA基因扩增酶切、ERIC-PCR)制备DNA样品,使教师可以根据自身的条件采取不同的方法进行实验准备。设计了通过DNA琼脂糖凝胶电泳的结果比较来找出罪犯的实验环节,从而使得该实验的准确性、重复性和吸引力大大提高。 相似文献