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藻蓝蛋白是红藻和蓝绿藻中一种重要的捕光色素蛋白．克隆了编码极大螺旋藻藻蓝蛋白α和β两个亚基的基因，序列分析表明该基因全长为1119bp．β亚基基因位于α亚基基因上游，两个亚基基因序列长度分别为519bp和489bp，中间被111bp的基因片段间隔．除编码α和β两个亚基的开放阅读密码框外，还存在两个潜在的开放阅读密码框，但这两个密码框的意义还不清楚．比较了该藻蓝蛋白氨基酸序列和来自于其他藻类的藻蓝蛋白氨基酸序列的同源性以及藻蓝蛋白α和β两个亚基之间氨基酸序列的同源性，总的来说其同源性在45．9％．99％之间，α和β两个亚基氨基酸序列同源性为27．1％．藻蓝蛋白包含许多疏水性氨基酸，这些疏水性氨基酸在藻胆蛋白的聚集过程中起着极为重要的作用．分析表明编码藻蓝蛋白α和β两个亚基基因的密码子显示出非对称性． 相似文献
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为研究斜纹夜蛾核型多角体病毒（Spodoptera litura muhicapsid nucleopolyhedrovirus．SpltMNPV）侵染规律，根据SphMNPV中国株（G2）ORF135基因序列设计引物，经PCR扩增，从SpltMNPV日本株（B）基因组中克隆了pif-2基因。核苷酸序列分析表明，该基因是甜菜夜蛾核型多角体病毒（Spodoptera exigua nucleopolyhedrovirus，SeMNPV）pif-2的同源物，读码框含1278bp，编码425个氨基酸的蛋白质，推定分子量为48．6kD。与其他杆状病毒的同源物比对显示．SpltMNPV-JP-B PIF-2蛋白中14个Cys残基高度保守。联配分析表明，SphMNPV-JP-B pif-2的核苷酸序列与其他13种核型多角体病毒的同源性有较大差异。将pif-2克隆至原核表达载体pET32a（＋），经IPTG诱导后在大肠杆菌BL21中获得了融合表达，SDS-PAGE分析表明在约69kD处有特异性表达条带，经Western blot验证该蛋白即为融合表达的目的蛋白。 相似文献
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从斜纹夜蛾核多角体病毒（Spodoptera litura multicapsid nucleopolyhedrovirus,SpltMNPV）日本株（C3）基因组中克隆了ie0基因。核苷酸序列分析表明,该克隆片断涵盖了864 bp的读码框及5′端启动子区475 bp和3′端终止区90 bp的序列。氨基酸序列分析显示,在SpltMNPV IE0蛋白N-端23～47位以及111～126位富含酸性氨基酸和疏水性氨基酸残基,C′端第225～271位具有典型的CX2CX14CCX4CX2CX15CX2C双锌指基序,该结构在所比较的9个昆虫杆状病毒IE0蛋白中是十分保守的。联配分析表明,SpltMNPV日本株（C3）的核苷酸序列和氨基酸序列与其他9种核多角体病毒的同源性有较大差异。以ie0基因为基础绘制的杆状病毒分子进化树将家蚕核多角体病毒（Bombyx mori Nu-cleopolyhedrovirus,BmNPV）与苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒（Autographa californica multicapcid nucle-opolyhedrovirus,AcMNPV）归到同一分枝,这与以p10、gp37和egt基因为基础绘制的杆状病毒分子进化树结果一致。并进行了大肠杆菌表达和Western Blotting分析。 相似文献
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目的克隆小鼠内皮抑素（Endostatin）编码区cDNA序列及测序鉴定并构建pEgr-IFNγ-EndostatinA基因表达载体。方法从小鼠肝细胞提取总RNA，经逆转录一聚合酶链式反应（RT-PCR）扩增获得全长Endostatin基因，测序并利用基因重组技术构建pEgr-IFNγ-EndostatinYT．基因共表达质粒。结果分光光度计测定50倍稀释的总RNA抽提产物，A260=0．834，A280=0．407，A260：A280=2．049，总RNA浓度为1．668g／L。EndostatincDNA的RT-PCR产物与载体pMD18T连接并经测序证实Endostatin序列与文献报道完全一致，并构建了含Egr-1启动子的IFNγ和DEndostain双基因共表达质粒pEgY-IFNγ-Endostatin。结论成功克隆小鼠Endostatin基因，构建了pEgr-IFNγ-Endostatin双基因共表达质粒。 相似文献
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浙江沿海一新纽虫的18S rDNA序列研究 总被引：1，自引：0，他引：1
为进一步确定浙江沿海发现的一新纽虫的分类地位，本文根据GenBank中已报道的纽虫18SrDNA保守序列设计引物，通过PCR扩增，获得该纽虫的18SrDNA部分序列，对该纽虫的18SrRNA基因进行了克隆和序列分析。并将该纽虫18SrDNA基因的序列与NCBI数据库中已收纽虫的18SrDNA基因进行了比较，分析该纽虫与其他纽虫的同源性。利用系统进化树和形态学的研究结果确定其分类地位。结果表明，该纽虫属于异纽目（Heteronemertea）纵沟虫科（Lineidae）动物。 相似文献
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文章以樱草杜鹃、大花黄牡丹、长鞭红景天、露蕊乌头、苞叶雪莲、藏橐吾、独一味、砂生槐、拉萨蒲公英、拉萨小檗10种藏药材为研究对象,提取基因组DNA,对其线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)的部分片段进行了PCR扩增、测序及序列分析,用Bioedit软件与Gen Bank数据库中相关植物的序列进行序列比对,并用MEGA6.0软件做系统进化树(NJ),运用Codon W软件计算密码子的RSCU值。通过PCR扩增获得了10种藏药材的长度为750bp的目的片段,通过序列比对发现cox3基因在不同植物中变异位点较少,序列比较保守;基于cox3部分基因序列构建的NJ树反映了物种的进化关系,可以作为物种系统发育分析的补充;密码子偏好性分析发现,cox3基因偏好使用以AU结尾的密码子。樱草杜鹃等10种藏药材的COXⅢ基因部分片段的扩增与序列分析从序列比对分析、构建系统进化树、密码子偏好性分析水平上分析了cox3基因部分序列在樱草杜鹃等10种藏药材的差异,为植物cox3基因的功能、表达研究奠定了基础。 相似文献
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溶藻弧菌铁调蛋白基因的克隆、表达及其特征分析 总被引：1，自引：0，他引：1
铁为一切有机体所必需。对铁摄取与利用的调控在细菌生长和铁毒性中起重要作用。在革兰氏阴性细菌中,铁摄取调节蛋白(Fur)主管铁的代谢。溶藻弧菌是人和海洋动物共感染的一种主要病原弧菌。本研究克隆表达了溶藻弧菌的fur基因,并分析了其相关特征。该基因序列全长994 bp,其中包含450 bp的开放读码框,编码150个氨基酸残基的蛋白,推导的相对分子量为16.78 kD.在编码序列的上下游,RBS序列-、10序列-、35序列和二个潜在的转录终止子分别得到确定,但没有发现存在于大肠杆菌fur基因中的"铁盒子"。氨基酸序列的中段从G46位至D104位,为高度保守区域,其中包括含组氨酸丰富铁结合模型(H3-D-H-L-V-C-L-D-C-G)。SDS-PAGE分析表明,fur基因可在大肠杆菌中大量表达,带His-Tag的重组融和蛋白经镍亲和层析得到纯化,Western-blot分析结果显示,Fur蛋白具有免疫反应性。为进一步研究Fur蛋白的结构与功能打下基础。 相似文献
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目的:构建真核表达IL-18-GPI融合基因的表达载体,观察融合蛋白在哺乳动物细胞中的表达动力学及生物学活性,为进一步研究细胞因子作为免疫增强剂在临床肿瘤治疗中的应用奠定基础.方法:通过RT-PCR的方法从脂多糖刺激的外周血淋巴细胞中钓取IL-18基因,通过共用限制性酶切位点与GPI相连形成pcDNA-IL-18-GPI真核表达质粒.将质粒转染CHO细胞后建立稳定表达融合蛋白的细胞株用于融合蛋白的提取.对提取纯化的蛋白进行生物学特性、蛋白质转移分析和γ-IFN诱导实验.结果:获得714 bp的核酸序列并构建重组质粒pcDNA-IL-18-GPI.SDS-PAGE和West-blot显示在CHO细胞中表达的IL-18-GPI融合蛋白分子量约为27.5 kD,该蛋白具有明显的蛋白转移和诱生γ-IFN的作用.结论:IL-18-GPI融合蛋白是一种潜在的肿瘤疫苗增强剂,具有良好的应用前景. 相似文献
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Renu Yadav Babban Jee Sudhir Kumar Awasthi 《Indian journal of clinical biochemistry : IJCB》2015,30(1):109-112
Curcumin is a major bioactive compound of turmeric that exerts its anti-inflammatory effects by suppressing the many pro-inflammatory cytokines and chemokines in a number of cell types and pathologic conditions. Interleukin-18 (IL-18) is a novel pro-inflammatory cytokine which plays an important role not only in generating Th1 responses but also in inducing severe inflammatory reactions. As curcumin induced inhibition of IL-18 production in keratinocytes and mice is well known, effect of curcumin on IL-18 release in macrophages remains unknown. Hence, this present study has been designed to evaluate the effect of curcumin on IL-18 production and necrotic cell death in murine macrophages-like cells treated with or without lipopolysaccharide (LPS). The IL-18 secretion in cell culture supernatants was assayed by enzyme-linked immunosorbent assay and cytotoxicity was determined by lactate dehydrogenase release assay. Our results demonstrate that curcumin significantly inhibited the production of pro-inflammatory cytokine IL-18 in E.coli LPS stimulated murine macrophage-like cells RAW264.7 in a concentration-dependent manner. Interestingly, curcumin had no cytotoxic effect on murine macrophage-like cells. Our findings suggest that curcumin may be used as a potential therapeutic agent for the treatment of inflammatory diseases. 相似文献
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目的:设计获得5段hIL-18异构体,定向插入pEGFP-C1质粒形成融合基因,转染胰腺癌Bx-PC-3细胞并表达,为进一步研究改建的hIL-18蛋白功能奠定实验基础.方法:设计引物从pGEM-T-hIL-18质粒中PCR扩增得到5段不同的hIL-18片段,分别连接入pEGFP-C1载体构建不同的突变子(Mu0、Mu1、Mu2、Mu3和Mu4),转染原位胰腺癌BxPC-3细胞,以荧光显微镜观察绿色荧光蛋白的表达,RT-PCR法检测转染细胞中hIL-18表达水平.结果:(1)五种重组质粒经酶切与测序证实构建成功;(2)BxPC-3细胞转染重组质粒后可观察到绿色荧光蛋白的表达.结论:(1)成功构建了hIL-18五种异构体的绿色荧光蛋白表达载体;(2)改建的hIL-18蛋白可与绿色荧光蛋白在BxPC-3细胞融合表达. 相似文献
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总结反映黏土孔隙比随固结压力的变化规律的e-logp模型,Ec-p模型,log(e ec)-logp模型等3种非线性压缩模型的基础上,提出了考虑先期固结压力影响的log(e ec)-log(p-pc)压缩模型。利用GDS高级固结仪对萧山原状黏土的7个试样进行了分级加载固结试验,整理固结压力与孔隙比等试验数据,分别确定了4种压缩模型的土性参数。试验与分析结果表明传统固结理论用黏土压缩系数av1-2代替变化值av,降低计算精度,且不能反映黏土的非线性压缩规律;大变形与小变形确定的孔隙比e数值上基本相同;从拟合结果与实用角度出发,选取ec=1的log(e ec)-logp与log(e ec)-log(p-pc)压缩模型最适用于描述萧山黏土的非线性压缩特性。 相似文献
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hCLP46是从MDS-AML的CD34＋细胞cDNA文库中筛选出的一个新的基因，为了进一步对该基因进行功能、性质研究，本实验利用RT-PCR技术对该基因进行了组织特异性表达检测，并将该基因构建到真核表达载体pcDNA3.1(+)中，转染U937细胞，发现过量表达该基因的U937细胞能够抑制TGF-对p15基因的上调。此外，利用生物信息学手段对该基因进行序列分析，得到其启动子区存在一个典型的“CpG island”。提示该基因有可能参与甲基化调节途径。通过本文的研究，为进一步研究该基因的作用机制打下基础。 相似文献
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mRNA在细胞质内的稳定性是调控基因表达的重要方式。细胞以mRNA降解的方式对过时的、突变有害的mRNA进行及时清除以保证基因的正确表达和细胞正常的生命活动。其中脱帽酶Dcp1/Dcp2在mRNA降解中起到主要作用，但对其降解mRNA的详细作用机制了解甚少。到目前为止，尚没有该基因市售的抗体出现，阻碍了对该基因机理的研究。本文目的是利用PCR方法，从人的胎肝文库中克隆到Dcp2基因，制备其多克隆抗体血清。实验结果显示，通过溴化氰偶联柱子对该多克隆抗体血清经纯化得到的多克隆抗体，用于Western Blotting 试验，可以检测到该蛋白内源性的表达；用于激光共聚焦定位实验显示该内源性蛋白定位在细胞核内；此抗体同时可用于免疫沉淀实验。因此Dcp2基因和多克隆抗体的获得，为进一步研究该基因的功能创造了条件。 相似文献
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Namdev S. Togre Priyanka S. Bhoj Vishal K. Khatri Aditya Tarnekar Kalyan Goswami Moreshwar R. Shende M. V. R. Reddy 《Indian journal of clinical biochemistry : IJCB》2018,33(3):282-289
Helminthic infections lead to the release of various molecules which play an important role in modulation of the host immune system. Such filarial proteins with immunomodulatory potential can be used for therapeutic purpose in inflammatory and immune mediated diseases. In the present study, we have explored the prophylactic effect of filarial SXP–RAL family protein of Wuchereria bancrofti i.e. rWbL2 protein in DSS induced inflammatory ulcerative colitis in a mouse model. Prior treatment of rWbL2, followed by induction of colitis, showed significantly reduced disease severity as indicated by the decreased disease manifestations and improved macroscopic and microscopic inflammation. This preventive effect was found to be associated with increased release of anti-inflammatory cytokine IL-10 and decreased release of proinflammatory cytokines IFN-γ, TNF-α, IL-6 and IL-17 by the splenocytes of treated mice. From this study, it can be envisaged that pretreatment with filarial protein, rWbL2, can prevent the establishment of ulcerative colitis in BALB/c mice. The underlying immunological mechanism may involve the up-regulation of Th2 immune response with down-regulation of Th1 response. 相似文献